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核磁共振与多方法整合研究非编码RNA的动态结构

主讲人:龚洲(中国科学院精密测量科学与技术创新研究院) 上传时间:2021/11/04 18:11
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核糖开关是一种广泛存在于细菌和真菌体内,具有多种调控功能的单链非编码RNA。核糖开关通过结合小分子配体来实现自身构象的动态变化,从而实现对转录过程和翻译过程的调控,而这种调控的效率也会受到其所处环境的影响。溶液核磁共振方法能够在不同温度下对非编码RNA的结构和动态变化进行准确的分析和研究。我们通过整合溶液核磁共振,以及小角X射线散射,全原子分子动力学模拟和荧光滴定等方法,对preQ1核糖开关在结合配体和不结合配体两种状态下的系综结构进行了表征。我们的研究表明,preQ1核糖开关在其所处的生理温度条件下会呈现出多种不同的构象状态,而这些不同的构象状态与preQ1核糖开关功能的实现是相适应的。进一步,我们发现preQ1核糖开关的二级结构和三级结构能够被loop区的长度来调控,而loop区的长度也跟不同物种为了适应不同的温度环境相关。我们的研究揭示了preQ1核糖开关对不同环境温度适应性的本质,为深入理解核糖开关行使功能的机制提供了基础。

讲师简介:

致力于通过分析生物大分子(包括蛋白质、RNA等)在不同时空尺度下的结构变化揭示其行使功能的分子机制,发展了包括溶液核磁共振、化学交联质谱分析、单分子荧光、小角散射等在内的多种新方法或整合方法用于生物大分子动态结构与功能研究,取得了一系列的研究成果。近五年在包括Angew Chem Int Ed, PNAS, Protein & Cell在内的权威期刊发表研究论文20余篇。入选中国科学院青年创新促进会,主持国家重点研发计划课题一项,国家自然科学基金面上项目一项、国家自然科学基金青年科学基金一项。作为主要骨干参与多项重大或重点项目。

相关领域:

(生物产业)-(生物发酵)

相关仪器:

(化学分析仪器)-(波谱仪器)-(核磁共振(NMR))

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