世界各国在作物育种上的竞争,某种程度上是利用“基因资源”能力的竞争。最近几年,作为油菜育种的一项“基础建设”,我们对世界核心油菜种质资源进行了全基因组测序,产生了大量数据。要有效地利用这些数据,很大程度上依赖编程技术与用户端的命令行环境,这对于大多数作物育种工作者来说,是一项具有难度且耗时、耗力的工作。我们发布了BnaSNPDB网站,一个用户界面友好的交互式网站,它保存了一千份以上油菜基因组数据,提供了连锁不平衡分析、基因聚类进化树分析、基因分型、以及GWAS分析等多种分析模块,用于检索、分析和可视化油菜种质资源的单核苷酸多态性。此外,我还将介绍通过父母本基因组的配对,预测F1代杂种优势的方法,我们引入区域亲本遗传相似指数(PGSI)的概念,采用机器学习的方法,初步建立了杂种优势预测的模型。初步结果表明,油菜C亚基因组对杂种优势的影响大于A亚基因组。我们绘制了与各种农艺性状的杂种优势相关的QTL,并对高影响的h-QTLs进行了鉴定和注释。利用我们建立的模型,可以在计算机上模拟不育系和潜在恢复系之间的配合力,从而可以节省大量的田间杂交等工作。