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安捷伦代谢组学整体解决方案
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干细胞是一类具有自我更新能力和多向分化潜能的细胞。2012年诺贝尔生理学或医学奖得主山中伸弥于 2006 年,通过将四个转录因子(Oct4、Sox2、 Klf4 和 c-Myc)导入小鼠胚胎的和成体的成纤维细胞中,首次实现了将体细胞诱导为多能干细胞,自此拉开了诱导多能干细胞研究的序幕。诱导性多能干细胞(iPSCs),是指通过导入特定的转录因子将体细胞重编程为多能性干细胞。iPSCs可以体外培养、扩增、分化为不同的细胞类型,解决了长久以来利用胚胎干细胞(ESCs)研究疾病的伦理问题,成为研究疾病治病机制、筛选个性化药物、细胞治疗的有力工具。为综合探讨诱导多能干细胞的构建、培养和扩增,仪器信息网将携手赛默飞“重返实验室”系列活动之“Lab实验课堂”,开展【干细胞请回答】- 如何构建、培养和扩增理想的“种子细胞”iPSCs,我们将邀请北京大学生命科学院 王金琳 博士后 、 赛默飞世尔科技技术支持唐子华 博士,围绕iPSCs的构建、培养和扩增,展开深度讨论。
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本报告将介绍荧光寿命成像技术,重点介绍FLIM-FRET技术,及荧光寿命成像技术应用及进展,其中重点介绍荧光寿命成像技术在固定或活细胞内蛋白相互作用研究中的应用。
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SELECT SERIES Cyclic高端离子淌度质谱助力生物大分子结构表征
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HF180新品产品特色及产品介绍
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徕卡可以为生命科学研究提供丰富的常温以及冷冻电镜制样方案,包括常温低温超薄切片,高压冷冻,真空镀膜,临界干燥,真空冷冻传输等技术。徕卡更是在光学的技术上开发了常温与冷冻光电联用技术路线,可更好地为电镜客户提供荧光定位筛选以大大提高目标选样效率以及实验成功率。
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日本电子冷冻电镜CRYO ARM基于“快速、易于操作、获得高对比度和高分辨率图像”的理念而开发。第二代CRYO ARM可进行高质量数据的快速采集、操作简便。其主要特点包括:通过最佳电子束控制实现高速成像,独特的科勒照明模式允许均匀电子束照射到样品的特定位置;配备了新型冷场发射枪(cold FEG)、柱内 Omega 能量过滤器;提高了高质量图像采集的硬件稳定性和采集速率。
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扫描透射电子显微镜(STEM)是一种功能强大的成像技术,在材料科学研究中得到了广泛的应用。将STEM应用于生物研究的尝试已经进行了几十年,但由于存在剂量限制和非线性方面的瓶颈,应用仍然受到限制。近年来,积分差分相位衬度(iDPC-STEM)技术应运而生,实现了线性相位衬度成像条件,即使在低电子剂量下也能分辨轻元素和重元素,这使得对光束敏感材料的成功研究成为可能。目前这一技术在材料领域已经实现了对O/N等轻元素直接成像,以及在低剂量下对电子束敏感的金属有机骨架实现原子分辨的成像。我们研究了iDPC-STEM在生物学方面的优势,特别是在常温树脂包埋以及冷冻聚焦离子束减薄的细胞/组织样品中,通过与常规TEM的比较,我们发现iDPC-STEM不仅显示了更好的对比度,而且在低电子剂量条件下可以在分子水平上展示更多的结构细节。这表明,iDPC-STEM在生物学研究中具有广阔的应用前景,为精确解析生物体的三维结构提供了更多的可能性。
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The cellular functions are executed by biological macromolecular complexes in nonequilibrium dynamic processes, which exhibit a vast diversity of conformational states. Solving conforma-tional continuum of important biomolecular complexes at atomic level is essential to understand their functional mechanisms and to guide structure-based drug discovery. In this talk, I will discuss on our recent development of a deep manifold learning framework, named AlphaCryo4D, which enables atomic-level cryogenic electron microscopy (cryo-EM) reconstructions that approximately visualize conformational space of biomolecular complexes of interest. AlphaCryo4D integrates 3D deep residual learning with manifold embedding of pseudo-energy landscapes, which simultaneously improves 3D classification accuracy and reconstruction resolution via an energy-based particle-voting algo-rithm. By applications of this approach to analyze several simulated and experimental datasets, we demonstrate its generality in breaking resolution barrier of visualizing dynamic components of functional complexes, in choreographing continuous inter-subunit motions and in exploring their hidden conformational space inaccessible to conventional methods. Integration of our machine-learning approach with time-resolved cryo-EM further allows visualization of conforma-tional continuum in nonequilibrium regime at atomic level, thus paving the way for therapeutic discovery against highly dynamic biomolecular targets.
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聚焦离子束(Focused ion beam, FIB)技术利用高强度离子束(通常是镓离子)对材料进行纳米加工,已广泛应用于材料科学领域,其原理是高速离子束与样品表面原子进行碰撞达到切割的效果。近年来,利用冷冻聚焦离子束减薄技术(Cryo-FIB)制备生物样品冷冻含水切片,并结合冷冻电子断层成像技术(cryo-Electron Tomography ,cryo-ET),对冷冻固定在近生理状态下的生物样品进行冷冻透射电镜低剂量模式系列倾转成像,解析胞内亚细胞结构乃至生物大分子复合体的高分辨率三维结构,在原位对生物大分子的结构进行解析,进而阐明其发挥功能的分子机制,已经成为原位结构生物学研究的技术前沿和研究热点。