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生态环境部华南环境科学研究所拥有颗粒物空气动力学粒径谱仪、快速微生物鉴定仪、便携式多组分气体分析仪、气质联用仪、小流域物理模型（径流实验平台）、三重四级杆气质联用仪、质谱仪、增强型连续流动分析仪、快速液相色谱三重四极杆质谱仪、颗粒物硫酸盐在线观测仪等科研仪器。
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