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中国医学科学院医药生物技术研究所拥有病毒颗粒计数系统、气质色谱仪、多功能实时无标记细胞分析仪、全自动实验室合成反应器、液相芯片系统、自动多肽微波连续合成仪、质谱仪（抗生素快速检测鉴别系统）、切向流超滤器、沉默基因探测系统、活细胞高内涵图像分析系统等科研仪器。
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