柱式腐殖酸清除剂

柱式腐殖酸清除剂

Column Humic Acid Scavenger

用绝大多数文献报道的方法从土壤或湖海沉积物中提取的DNA都含有棕黑色或黑色的腐殖酸的污染，用的土壤DNA提取试剂盒从泥碳(腐殖酸含量超过50%)等腐殖酸丰富的土壤样品中提取的DNA也有腐殖酸污染，它们往往对PCR等后续反应有极大的抑制作用。本产品专门用于从土壤DNA样品中清除腐殖酸污染。

产品特点：
1.去污染效果好，能使腐殖酸的浓度降低10倍以上。
2.DNA回收率高，一般都在80%以上。
3.操作过程简单快速，只需要10分钟。
4.扩容性好，可小规模操作，也可以大规模操作。
5.处理后的样品原液或稍微稀释后即可用于PCR。

试剂盒组成：

储存条件：常温运输及保存，有效期一年。

使用方法：
1.将0.3mL专用上柱液与50μl或50μl以下的含腐殖酸的DNA溶液轻柔混匀。如果DNA溶液体积超过50μl，专用上柱液的体积需按1:6(DNA溶液:专用上柱液)的比例相应增加。不要剧烈震荡，否则DNA容易断裂。
2. 将离心管中的溶液转移到离心吸附柱中，套上收集管，放于离心管架上，静置3～5分钟，12000～15000g离心1分钟并倒掉收集管中的液体。若一次加不完，可分两次加入并离心。
3. 加入0.5mL通用洗柱液于离心柱中，12000～15000g离心1分钟，倒弃收集管中的废液。
4. 重复第3步操作1次。
5. 12000～15000g离心1分钟以去除离心柱中的残留液体。
6. 将离心柱置于一新的干净的离心管(自备)中，加入50μl通用洗脱液，静置3～5分钟，12000～15000g离心1分钟。
7.离心管底部所得溶液即为纯化的DNA溶液，可立即用于后续实验或者放冰箱长期保存。

使用效果：

图注：从泥碳(腐殖酸含量大于60%)中提取的DNA用本产品处理前(B)和处理后(A)的颜色对比。处理前OD340为4.0(4为所用分光光度计的上限，实际读数可能远高于4)，处理后降低到0.3。处理前的原液、10倍和100倍稀释液均无PCR扩增，而处理后均可以扩增。

疑难解答：
Q: 如何判断提取的DNA没有腐植酸污染？
A：方法一是目测法，即看得到的溶液是否无色。如果呈淡棕黑色或淡黄色，说明可能是少量残留的未除尽的腐植酸。方法二是检测最大光吸收。注意：有腐植酸污染并不表示DNA不能使用，有的腐殖酸并不抑制PCR扩增。
Q: 腐殖酸的最大吸收波长是多少？
A：腐植酸(humic acid)是一大类呈棕黑色或黑色的物质,其结构千差万别，土壤中腐殖酸的组成和特点随土壤不同而不同，所以其最大吸收波长也各不相同。有的土壤的腐殖酸的最大吸收波长在260nm(见Appl. Environ. Microbiol.，63：4993，1997)，有的则在340nm，所以用特定的波长测定OD值时波长的选定要根据土壤而决定。Sigma，Fluka等公司出售的腐植酸产品成分一般比较简单，其最大吸收波长不能推广到成分更为复杂的土壤腐殖酸样品。
Q:是否腐植酸都会抑制后续的DNA反应？
A：否，因为腐植酸是一大类物质的统称，他们的结构和特性各不相同，所以是否对后续反应有影响最好通过实验来验证。如果用提取的DNA溶液原液进行反应而反应没发生，而对照样品(已知的不含污染的DNA)能够发生，说明可能有抑制作用。
Q：除本方法外，还有什么有效方法去除DNA样品中的腐植酸？
A：可以先电泳，然后用超大片段胶回收试剂Magic Gel DNArc(BTN60706)纯化DNA，如此得到的DNA原液一般可以直接扩增。
Q：本产品与柱式DNArc有何区别？
A：本产品由柱式DNArc改进而来，主要区别一是使用了不同的上柱液，减少了硅胶膜对DNA的非特异吸附，更适用于微量DNA样品；二是上柱液中含有腐殖酸去除试剂，适合于土壤DNA样品。
Q：在用土壤DNA进行细菌专一性PCR时，为何没加DNA模版的阴性对照有扩增产物出现？
A：这是由于使用的Taq DNA聚合酶一般从E.coli表达菌株中提取，提取过程中污染了E.coli的基因组DNA，而使用的广谱细菌专一性引物可以识别所有细菌DNA基因组DNA模版，所以会产生扩增。建议使用高质量的Taq DNA聚合酶。

特别提示：本公司的所有产品仅可用于科研实验，严禁用于临床医疗及其他非科研用途！