微生物基因组组装及注释分析系统

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品牌

柏熠科技

样本

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型号

BS-Assem001

荣誉奖项

产地

中国大陆

杭州柏熠科技有限公司

一般经销商

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核心参数

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简介

微生物基因组组装及注释分析系统，是由杭州柏熠科技有限公司开发的一款提供图形操作界面的测序数据分析系统。组装模块的提供可以更好的对测序的物种信息进行评估，相较于传统微生物培养和荧光定量PCR技术，全基因测序技术能够高效获得物种基因组信息、变异信息、物种差异等，克服检测周期长、操作繁琐、通量低等问题。本系统兼容三代Nanopore和二代原始测序数据，可实现实时快速分析，提供三代有参组装、无参组装、混合组装、二代单双端组装模式。可以使用户快速得到组装结果、覆盖度、统计信息、耐药和毒力分析、基因注释、MLST等结果。本系统提供从下机数据到结果报告一键式操作，与常规linux shell命令行调用多种程序测序数据分析相比，解决了操作难度大、分析可视化复杂等问题。通过高度优化的集成分析流程与完善的数据库，最终实现一键式图形界面分析，最快分析时间可缩短至10分钟内。

功能介绍

本系统同时支持Nanopore、Pacbio等三代测序数据和Illumina、MGI、Ion Torrent等二代测序数据进行生物信息学分析，具体功能如下：

1.支持主流二代和三代测序下机数据的分析；

2.提供从下机数据到分析结果一键式操作；

3.支持多个主流组装软件选择，提供无参，有参和混合组装三种组装方式；

4.支持多样本和不同格式数据输入；

5.提供样本全基因组的覆盖度图和组装完成的一致性序列；

6.有参组装提供变异分析；

7.支持基因组组装结果注释，提供gff，gbk等注释文件；

8.提供耐药元件鉴定、耐药机理和耐药药物鉴定等分析；

9.提供毒力元件鉴定、毒力机理等分析；

10.支持MLST分析；