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Omnilog PM高通量表型测定系统
表型芯片(Phenotype Microarray,简称PM)是与基因芯片、蛋白芯片并列的三大技术之一。美国Biolog开发的PM系统收集了几乎所有已经发表的微生物和细胞的常见表型,通过建立标准的评价模式、分析检测工具及数据处理软件,建立一个用途广阔的平台,可广泛用于涉及微生物和细胞领域的所有工作者对微生物和哺乳动物细胞进行科学研究和产品开发工作,如基因功能研究、药物研究、代谢研究、发酵条件优化、产物优化、毒性研究等等。
PM技术在国外已经应用近十年时间,由于美国对高技术的出口一直采取封锁,PM技术直到2008年才正式进入中国,未来PM的应用前景不可估量。
PM技术的技术参数:
1.可用于纯种微生物或混合微生物细胞表型测试,如对单个功能菌株、混合菌株或土壤微生物菌群进行各种碳源、氮源、磷源和硫源、渗透压、pH值及各种化学敏感物质的表型特征分析;优化微生物的培养条件和产物生成条件;工程菌株的诱变研究及其它相关的应用和基础研究。
2 细胞表型芯片(PM)的各种PM板由主机完成培养和读数,系统定时测定颜色变化值,最后得到表型反应的动力学图曲线,从而定量测定表型反应的强弱。
3 系统可使用的PM板共25块,包括碳源板2块、氮源板4块、磷源和硫源板1块、生物合成路径板1块、渗透压及离子板1块、pH板1块及化学敏感物质板10块,酵母真菌板5块;哺乳动物细胞相关的PMM板有13块,包括碳源和氮源糖代谢板2块、离心板1块、激素板3块、抗肿瘤药物板4块、线粒体毒性测试板1块,孔内固定有冻干的各种相应的化学物质。
4 常用微生物表型测试达接近4000种,可以用于革兰氏阴性细菌、阳性细菌、酵母、丝状真菌及哺乳动物细胞等细胞表型的研究。
5 PM软件可以自动比较两个或多个样品的上千种表型,通过对不同样品及其表型反应的比较可以提供非常有用的信息。在两个样品有同样表型反应动力学的曲线标注为黄色,某一细胞系特有的表型反应标注为指定给该细胞系的特有曲线颜色。研究开发人员可以很快地看到图形方式的输出结果,并从视觉上判定两个细胞系之间的变化。两个细胞系有显著差异的地方,软件会自动标注、突出显示这个差异,并生成报告列出找到的细胞表型差异。
常用功能:
1 确定已知或未知基因的功能,发现某些特殊活性的酶;
2 微生物对营养物质的转运、碳、氮、磷、硫源的代谢特征;
3 优化微生物培养条件,优化微生物次级代谢产物的产生;
4 确定药物(如抗生素等)对微生物细胞的作用,研究不同药物之间的协同或拮抗作用;
5 通过寻找致病微生物的特异基因来发现新的抗生素作用位点;
6 通过比较表型分型,测试抗生素靶向位点和药物前体;
7 补充从基因和蛋白质水平上获得的信息。
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