吕海涛/方海/韩泽广团队合作发表质谱分子组学与人工智能融合创新传染病精准诊疗顶刊约稿综述。
鉴于致病微生物(细菌、真菌和病毒等)与宿主之间的多模态分子尺度的复杂相互作用,加快其突变与传播,诱发的传染性疾病已经成为人类健康的最大挑战,给各国政府带来巨大的社会和经济负担。质谱作为一种先进的测量工具,在跨尺度和多模态分子表征领域独树一帜,前景可期。近年来,质谱驱动的分子组学分析策略,涉及代谢组、蛋白组、核酸修饰组学等,在传染性疾病基础与转化研究领域被广泛应用,取得良好进展,但仍有局限。基于此,我们系统梳理质谱驱动的多模态分子组学测量策略及其应用于传染性疾病精准诊疗的研究实例,重点分析质谱分子组学的分析模式、应用场景和转化应用发现。此外,梳理优势,总结不足,强调引入人工智能策略的必要性和可行性。最后,针对当前质谱分子组学应用方面的不足,以及与人功智能融合领域的缺憾,提出若干潜在分析策略,重点推出STORM+下一代功能代谢组学策略,以期面向未来新发传染病的巨大挑战,显著提升传染性疾病精准诊疗、管理与防控的综合水平。
基于上述科学问题与应对策略分析,受药理学顶刊《Pharmacology & Therapeutics》(中科院1区TOP, IF 12.0)执行主编约稿起草前沿综述文章"Artificial Intelligence with Mass Spectrometry Based Multimodal Molecular Profiling Methods for Advancing Therapeutic Discovery of Infectious Diseases",已经正式发表。香港浸会大学中医药学院/香港中医药表型组学研究中心/环境与生物分析国家重点实验室/疾病与组学全国重点实验室吕海涛教授、上海交通大学医学院附属瑞金医院/国家转化医学中心(上海)/疾病与组学全国重点实验室方海研究员和上海交大系统生物医学研究院/系统生物医学教育部重点实验室韩泽广教授为论文共同通讯作者,香港浸会大学中医药学院/香港中医药表型组学研究中心博士后研究员刘京净博士、上海交通大学医学院附属瑞金医院/国家转化医学中心(上海)/疾病与组学全国重点实验室吕海涛教授博士后研究员包超慧博士和香港浸会大学中医药学院/香港中医药表型组学研究中心博士后研究员张佳馨博士为论文共同第一作者。论文得到国家重点研发计划课题,国家自然基金面上项目,上海市自然基金项目,疾病与组学全国重点实验室首批揭榜挂帅项目和环境与生物分析国家重点实验室SKL-GRF项目的支持,在此一并致谢!
原文链接:https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0163725824001323
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