据近日发表在《自然》杂志上的论文,美国加州大学圣地亚哥分校和斯克利普斯研究所联合开发了一种名为“Freyja”的算法,用于在早期检测废水中的新冠病毒变异株,只需两茶匙未经处理的污水,就可准确测定新冠病毒变异株。
加州大学圣地亚哥分校在数十个地点通过自动采样机器人收集了废水样本,加州大学圣地亚哥分校的实验室分析了这些样本中的新冠病毒RNA水平,并在斯克利普斯研究所实验室做进一步的计算分析。
图片来源:埃里克·杰普森/加州大学公共艺术委员会
斯克利普斯研究所研究人员开发了一个“条形码”库,可根据每个变异株特有的短RNA片段来识别新冠病毒变异株,并编写了一种新算法,通过筛选废水中的大量遗传信息来匹配这些条形码。由此生成的免费程序Freyja,已经被美国公共卫生机构广泛用于废水监测。
研究人员表示,在实验室对废水样本进行测序后,只需运行Freyja,20秒就可得到结果。当研究人员将Freyja应用于废水样本并将结果与圣地亚哥市的临床数据进行比较时,他们发现该工具在临床报告前14天就在废水中检测出了“值得关切的变异株”,包括阿尔法、德尔塔和奥密克戎变异株。
2021年7月27日,研究人员在加州大学圣地亚哥分校的废水中检测到缪变异株9(B.1.621),这是在校园首次临床检测的4周前检测出来的。同年11月27日,该团队还在圣地亚哥首次临床报告前11天检测到废水中的奥密克戎变异株。
[来源:科技日报]
3626.7万元!中华人民共和国广州海关10月拟采购超过40台/套仪器设备
2024.08.26
4821.56万元!厦门大学9月仪器采购意向公布:聚焦生命科学领域
2024.08.26
2024.08.22
2024.08.21
2024.08.21
8035万元!河北师范大学公布2024年大型仪器设备更新采购清单
2024.08.21
版权与免责声明:
① 凡本网注明"来源:仪器信息网"的所有作品,版权均属于仪器信息网,未经本网授权不得转载、摘编或利用其它方式使用。已获本网授权的作品,应在授权范围内使用,并注明"来源:仪器信息网"。违者本网将追究相关法律责任。
② 本网凡注明"来源:xxx(非本网)"的作品,均转载自其它媒体,转载目的在于传递更多信息,并不代表本网赞同其观点和对其真实性负责,且不承担此类作品侵权行为的直接责任及连带责任。如其他媒体、网站或个人从本网下载使用,必须保留本网注明的"稿件来源",并自负版权等法律责任。
③ 如涉及作品内容、版权等问题,请在作品发表之日起两周内与本网联系,否则视为默认仪器信息网有权转载。
谢谢您的赞赏,您的鼓励是我前进的动力~
打赏失败了~
评论成功+4积分
评论成功,积分获取达到限制
投票成功~
投票失败了~