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一图看全!2022年全球顶级基因组技术峰会(AGBT)玩家
——尹哥聊基因
AGBT(Advances in Genome Biology and Technology,基因组生物学技术进展会)是基因组学、测序技术领域最高规格的会议之一,每年各大企业都会在会议上展示新产品、发布新动向。
出席会议的往往是基因组学等领域最具影响力的企业,其中不乏罗氏、碧迪等老牌强企,当然也有一些行业新势力会借这个舞台展现自己的能力。今年参加AGBT的企业共有41家,其中美国有34家、中国仅有华大智造(MGI)1家、来自其他国家的有6家;业务领域覆盖基因组、时空组、单细胞、实验仪器和试剂等。
在本届AGBT上,专家们认为,未来几年单细胞市场将以每年超过 20%的速度增长,空间组学技术也将齐头并进。而高增长组学技术、全空间转录组分析技术等也同样是受关注的热点话题。
2022年全球顶级基因组技术峰会玩家一览
又是一年技术峰会,看着参加名单,不由让人感慨,如果没有中国科学家夜以继日的坚持,我们何以一次次站上全球顶级基因组技术峰会的舞台。但此时此刻,我们仍有许多工作要做,科技的自立自强始终是奋斗出来的,唯有踔厉奋发、笃行不怠、方得玉成!
在会议即将召开之际,尹哥也想带大家认识这些站在山尖上的玩家们。
注:对于单细胞转录组的测序技术,如果同时记录了位置信息,过去称“空间组”或“空间转录组”,而华大在此基础上,叠加了不同时间点取样,此类技术就能为研究者提供时间及空间两个维度的信息,因此定义为“时空组学”技术。
这次峰会,尹哥也提炼了一些关键观点,借此机会和大家分享:
• Oxford Nanopore 长读长方法更加模块化,未来通量可大幅度提高,有可能成为最终的长读长赢家。
• Pacific Bioscience的SBB比其他中通量产品更具有优势,Q40>90%。而其他玩家如Element AVITI Q30约95%,Illumina NextSeq和Singular Genomics的NGS测序仪G4有相似精确度(2x150bp)。PacBio长读长在临床实验室/研究中具有潜在的利基市场,但短读长全基因组定价700 美元的高价可能会对该市场有所限制。
• Element产品,在服务上可立即打入中通量实验室市场。Element准确性优于 Ultima 与 Illumina,但从中通量到高通量的平台化,仍然是临床客户考虑的重要因素。配置中通量平台的实验室通常需要快速周转时间,且可能缺乏大量样品供应。
• 运行时间是中通量测序的关键价值。Singular Genomics 的NGS测序仪G4 运行时间最快为19小时,其次是Illumina NextSeq (P3) 和Element AVITI用时48 小时(2x150bp)。
• 在临床实验室环境中转换成本高。CAP 和 CLIA 等对核心实验室与临床实验室的高标准要求,对于已使用NovaSeq的实验室采用新的工作流程/系统非常困难。另一方面,由于Illumina软件及数据方面的限制和复杂性,切换到新系统可能需几个月的时间。
• 华大智造将于2022年8月底开始在美国市场销售基于COOLMPS测序试剂的DNBSEQ-G400C,这款测序仪在全球已经有超过1000台装机,能为中通量测序实验室提供高质量测序数据,后续其他型号测序仪也将陆续进入美国,结合华大智造自动化仪器提供多元化的实验室方案。
[来源:尹哥聊基因]
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