生物质谱
近日, 东北农业大学满朝新教授团队 将基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)法与16S rDNA序列分析法,对于乳酸菌鉴定的准确性以及微生物系统分类学相关分析结果进行比较,实验结果表明: MALDI-TOF MS法鉴定乳酸菌具备快速、准确的优势,可作为一种快速、简便、高效率的微生物鉴定技术,应用于多个领域之中。
相关研究已发表在《中国乳品工业》期刊上。
乳酸菌(lactic acid bacteria,LAB)是一类能利用可发酵碳水化合物产生大量乳酸的细菌的统称,其在自然界分布极为广泛,且绝大部分都是人体内必不可少的、且具有重要生理功能的菌群。目前,乳酸菌作为国内外常用的益生菌,在我国卫生部2010 年4 月公布的《可用于食品的菌种名单》中,包括6 种双歧杆菌、14 种乳杆菌、1 种链球菌,均属于乳酸菌。
乳酸菌有着十分重要的经济价值。但由于其属种较多,为更好的对其分类,使用快速、可靠的分类鉴定方法显得尤为重要。
目前常用的乳酸菌鉴定方法是16S rDNA 序列分析法,然而该方法存在操作条件要求严格、花费时间较长、费用较高的问题,极大限制了其鉴定时效性,无法满足乳酸菌快速、廉价及高通量的鉴定要求。
文章摘要
本研究通过将基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)法与16S rDNA序列分析法,对于乳酸菌鉴定的准确性以及微生物系统分类学相关分析结果进行比较,采用MALDI-TOF MS对本实验所保藏的3株乳酸菌标准菌株,及由乳制品中分离得到的12株乳酸菌进行蛋白质谱图收集,比对谱图特征峰对其进行鉴定及系统进行学分析;同时,进行16S rDNA提取并测序,得到分子生物化学水平鉴定,采用邻近连接法对16S rDNA序列进行系统进化树分析。
结果表明,MALDI-TOF MS法鉴定乳酸菌有着快速、准确的优势,可作为一种快速、简便、高效率的微生物鉴定技术,应用于多个领域之中。经MALDI-TOF MS与16S rDNA测序对试验所用的15株乳酸菌鉴定,乳杆菌属的2株微生物种水平鉴定结果存在偏差,其他13株鉴定结果一致;两种方法所得到的数据均可得出聚类热图及系统发育树,可确定为同一科水平,不同属种水平微生物亲缘距离与位置有一定差异。
[来源:融智生物科技(青岛)有限公司]
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