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国家生物中心:与美国同步共享5株新冠病毒基因组序列

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分享: 2020/02/10 18:09:53
导读: 国家生物信息中心(CNCB)/国家基因组科学数据中心(NGDC)首批自主收录的5株2019新型冠状病毒基因组序列实现与美国NCBI核酸数据库GenBank数据同步与共享。

国家生物信息中心(CNCB)/国家基因组科学数据中心(NGDC)首批自主收录的5株2019新型冠状病毒基因组序列实现与美国NCBI核酸数据库GenBank数据同步与共享。

CNCB/NGDC建立的2019新型冠状病毒信息库(2019nCoVR)已汇交并整合全球范围内产出的82株病毒的87条非冗余基因组序列信息,是目前收录2019新型冠状病毒基因组数目最多的数据库。

为了进一步扩大2019-nCoV基因组序列应用范围,CNCB/NGDC与国际生物信息数据库建立了数据同步共享机制,第一批自主收录的5个2019-nCoV全基因组序列(序列编号为GWHABKF00000000-GWHABKJ00000000)已经在NCBI发布。通过共享机制,国内研究人员只需将数据递交一次,即可实现数据在CNBC/NGDC和NCBI同时发布。

据悉,从2020年1月以来,陆续有30余株2019新型冠状病毒的基因组序列被国内外科学家破译,绝大部分数据都递交到由德国建立的全球流感序列数据库(GISAID)系统。而2020年1月22日,我国搭建的新型冠状病毒信息库正式上线。国家生物信息中心/国家基因组科学数据中心一直致力于构建国家级组学数据存储与共享公共平台,力争第一时间为国内乃至全球科学家提供基因组数据的存管用服务。此次疫情爆发后,新型冠状病毒信息库上线,保持该病毒基因组数据发布动态,持续为国内外科研人员提供方便快捷的数据检索及下载资源。

 


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作者:毛豆豆

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