我思故我在
脂质组学在生命科学研究中占据非常重要的地位。但是,全面的脂质分析受到脂质结构多样性、性质复杂性的挑战。常用的基于质谱技术的脂质组学分析方法包括直接进样(“鸟枪法”)、色谱-质谱联用、基质辅助激光解离质谱成像等,而超高效液相色谱-高分辨质谱(UHPLC-HRMS)非靶向分析和UHPLC -三重四极杆质谱靶向分析是最常用的分析平台之一,存在着各自鲜明的优缺点。
近日,中科院大连化物所的许国旺研究员团队在基于UHPLC-HRMS联用技术分析脂质代谢物方面取得了新进展,研究结果发表在 Analytical Chemistry 杂志 (2018 Jun 8. doi: 10.1021/acs.analchem.8b01331.)。
该课题组结合非靶向和靶向方法的优势,建立了一种具有高检测覆盖度的拟靶向脂质组学分析方法,涵盖19个脂类,3377个脂质离子对,覆盖7000多种脂质分子结构。
该课题组首先使用UHPLC-HRMS联用技术在全扫(Full Scan)和数据依赖采集(DDA)模式下对不同来源的生物样品(细胞、组织、血浆)进行分析,根据获得的保留时间、精确分子量以及二级碎片信息对脂质分子进行归属。没有二级碎片的脂质分子通过与已知脂质或自建数据库中的保留时间和精确分子量进行比对,靶向提取脂质信息,以获得尽可能大的脂质覆盖度。
对于理论存在但是未被检测到的脂质分子(文中称扩展脂质),通过保留时间与已知脂质的酰基链的碳数或酰基链的双键数之间的关系对保留时间进行预测。根据脂质分子的结构特征以及质谱行为,建立包含已知脂质和扩展脂质的离子对数据库。
最后,将所有的脂质离子对应用到动态多反应监测中,建立基于液相色谱-质谱的高覆盖拟靶向脂质组学分析方法。该方法具有良好的线性、重复性,更低的检测线,更高的覆盖度,更好的数据质量,尤其适合大规模脂质组学分析。
该研究得到了国家自然科学基金项目、国家重点研究发展计划以及大连化物所创新基金的资助。
该论文作者:
Qiuhui Xuan, Chunxiu Hu, Di Yu, Lichao Wang, Yang Zhou, Xinjie Zhao, Qi Li, Xiaoli Hou, and Guowang Xu.
链接:
http://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.analchem.8b01331
标题:
Development of a High Coverage Pseudotargeted Lipidomics
Method Based on Ultra-High Performance Liquid Chromatography?
Mass Spectrometry
出处:
Anal. Chem., May 29, 2018, DOI: 10.1021/acs.analchem.8b01331
[来源:化学数据联盟]
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