近日,PacBio公司首席安全官Jonas Korlach在官网上发表博客表示,PacBio公司计划提高PacBio RS II测序平台的通量,使每SMRT cell一次运行可输出超过4GB数据,平均读取长度增加到15-20KB。
去年秋天该公司升级了测序聚合酶和化学染料(P6-C4),使每SMRT cell 数据输出量从0.5G提升到1GB,平均读长达到10-15KB。最初的PacBio RS II平台,一天运行16个SMRT Cell只能产生6.4G的原始数据。
PacBio公司计划通过提升化学试剂,操作流程及软件来提高测序质量。包括将单一聚合酶加载到芯片上,从而提高装载效率。
此外,该公司计划提升样本制备流程并将其简单化,为混合样本添加条形码,发布长插入片段和全长cDNA文库的操作手册。
在数据分析方面,PacBio公司计划与生物信息学团队合作开发更快的de novo组装基因组的算法,进一步开发Falcon assembler及其他软件来解决二倍体或多倍体基因组的分析工作,简化全长转录本测序、Iso-Seq™全长转录本/异构体测序以及人类白细胞抗原(HLA)单体型定相的工作流程。
[来源:测序中国]
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