通过添加去污剂,可干扰蛋白质和内毒素之间的相互作用,使层析的效果得以提高。同样,去污剂也能用于双相抽提法,内毒素可通过脂质A的碱性链与去污剂发生非极性作用而从水相中分离出来。三硝基甲苯系列的去污剂在水溶液中具有一种融合性空隙,在某一称为“云点(cloud point)”的关键熔度时,微团聚合成含水量少的小滴从而形成一种新的相态。内毒素被保留在富含去污剂的那一相里。之后通过离心或加热,这两相分离,富去污剂层在底部。如果有必要的话,这个过程可以一直重复,直至内毒素浓度达到下限值以下。三硝基甲苯X-114的云点是22℃,这在纯化蛋白质时是有利的。含内毒素的蛋白质溶液一般冷藏于4℃的温度下,实现两相分离时的温度大于22℃。三硝基甲苯X-110的云点是75℃,这对大多数蛋白质是不适合的。
用其他技术从克雷伯杆菌I-714中分离内毒素和外毒素比用两相清除法更为困难。Adam等采用三硝基甲苯X-114进行两相分离前后内毒素浓度相差100倍,最终的内毒素量为30EU/mg,脂多糖的生物活性丢失50%。Cotton等的结果与此相似,大约100倍的内毒素从质粒DNA中被清除,最终的内毒素含量是0.1EU/6ug DNA。此外,他们采用多黏菌素B作为吸附剂取得更好的效果。Liu等也使用三硝基甲苯X-114双相抽提法(图35-1)和亲和吸附剂对重组蛋白质如心肌钙蛋白Ⅰ肌红蛋白和肌酸激酶同工酶的去内毒素污染进行了验证。他们得出结论,相分离是最有效的方法,可以清除内毒素达98%~99%,最终的残留量为2.5~25EU/mg不等,具体因蛋白质的不同而异。
由于总有一定量的去污剂残留在蛋白质溶液中,这就需要用吸附活凝胶渗透层析法将其去除,而这又造成了10%~20%的产物丢失,且由于总要重复多次而费时费力。温度的波动使得一次进行大规模的操作有困难,而且这样又限制了那些生物多聚体分割成水相,特别是对于疏水的蛋白质和DNA来说。
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