产品推荐丨“存管算”系统在基因测序中的价值体现

新冠病毒的不断变异，对当下的防疫来说是一个巨大的挑战;新冠病毒的每一条RNA 都含有大约 30,000个核苷酸。这些核苷酸涵盖了病毒如何侵入人体、复制以及导致感染者临床表现的信息。每当病毒发生变异时，病毒的被检测能力、传播性以及其对疫苗的反应都可能隨之发生变化。医学工作者要想了解感染者感染到哪类病毒，就需要对采集到的样本进行检测，确定样本中病毒RNA分子具体序列情况，以此推断病毒的种类。完成这些工作，都离不开一种核心技术：“基因测序”。

我们知道，DNA是我们人类的遗传物质，DNA又叫脱氧核糖核酸，脱氧核苷酸由碱基、脱氧核糖和磷酸构成。组成DNA的四种碱基是腺嘌呤（A）、胞嘧啶（C）、鸟嘌呤（G）和胸腺嘧啶（T）。正是这四种不同的碱基决定了我们基因序列的差异，从而决定了自然界生物的不同特征。

也正是这些碱基的排列序列不同决定了自然界的生物功能。从一代的毛细管测序到第三代的单分子测序，都是为了弄清楚特定碱基的排列顺序。

基因测序涉及到海量的数据。例如，每个人的碱基对就有30亿对。这就使得基因碱基对的排列信息需要有一个稳定、高效、安全的数据处理系统。

上面也提到碱基对信息的读取过程涉及到海量的数据信息。数据的采集过程包括读取，删除，调取，暂存，存储等一系列的操作，还需要对接各类不同的应用（测序工具软件）。这就对我们测序平台的服务器以及存储系统对数据有自主的感知应用能力。极道分布式存储系统ALAMO和ANNA，在满足测序性能要求的基础上，实现了针对不同的应用场景、不同应用IO模型、不同的空间密度的感知，以对存储资源作出最优的调配。

针对基因测序的特点，建立强大的分布式索引系统，构建数据与特征，特征与特征，数据与数据之间的强关联关系，实现秒级查找任意文件，多种条件组合快速查询。进行多维有序的管理，生成动态，多层次，多维度的数据集。

“存管算”协同的智能数据系统，动态调节每个节点所需的计算框架、分配计算资源，让每一阶段计算都极速高效，还可以做到预判任务，以做出策略选择和定向优化，打通了计算/存储之间的壁垒，显著提升存储效率和并行能力，为基因测序平台提供了高效、稳定、可靠的支撑。

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