在世界卫生组织国际癌症研究机构(International Agency for Research on Cancer,IARC)发布的《结直肠癌筛查》(第17章,2019年版)中,通过统计各国肠癌发病率和死亡率数据证明:通过采取早筛措施,肠癌的发病率和死亡率呈双下降趋势。
目前,国内湖北省、浙江省等多地也已积极发起了面向大规模人群的肠癌早筛科研项目和民生项目。由于粪便DNA检测具备无创采样、灵敏度高、检出率高、受检过程方便快捷等优势,在这些项目里大多采用人粪便DNA检测作为一种新型的早期筛查手段。然而,在样本前处理的过程中,粪便是复杂、有异味且黏稠度高的样本,这对操作人员而言是一个不小的挑战。
因此,华大智造特别推出的MGIEasy粪便基因组DNA(人源)提取试剂盒,专注于从粪便样本中提取人源gDNA,同时搭配华大智造的实验室自动化平台,即可轻松实现万级以上样本量的大规模肠癌早筛。
MGIEasy粪便基因组DNA(人源)提取试剂盒采用了具备超强吸附性的纳米磁珠捕获技术和除杂技术,不仅能够从新鲜的或冷冻的人类粪便样本中有效提取高质量的人源基因组DNA,而且可以去除样本中大部分的微生物菌群对提取产物的干扰。提取产物可直接用于PCR、qPCR、基因测序等下游操作。此外,MGIEasy粪便基因组DNA(人源)提取试剂盒组分不含苯酚等有害成分,提取过程安全可靠。
1、提取质量高,提取性能稳定
样本类型:新鲜人类粪便样本
样本投入量:180-220mg
提取方式:
手工提取,基于MGISP-960的自动化提取、基于MGISP-NE384的自动化提取
提取结果:
(1)通过手工方式进行提取的产量可以达到10μg左右,同时进行qPCR检测,结果显示CT值均小于25;(2)在手工提取和自动化提取条件下,提取产量均可达到10μg左右,进行qPCR检测,结果显示CT值均小于25,且提取性能稳定,即自动化提取可达到人工提取的效果,且人工误差少,人工成本消耗低。
结论:
采用MGIEasy粪便基因组DNA(人源)提取试剂盒,通过对粪便中人源gDNA进行3种不同方式的提取,均可获得稳定的、高质量的提取产物。
2、自动化适配程度高年处理样本量>5万例
搭配MGI自动化设备MGISP-960,单轮可以处理近100人份的样本,一年可处理5w左右的样本量,单次运行最快可在60min内完成。*注:除了离心和磁珠分装,其他操作均可自动化进行。
搭配MGI自动化设备MGISP-NE384,单轮可处理近400人份样本,一年可处理5w以上人份的样本量,单次运行最快可在30min内完成。
*注:分液可搭配MGISP-960自动化完成。
大规模肠癌早筛样本前处理(采集+提取)一站式平台
样本采集:MGIEasy粪便样本采集套装
样本分装:MGISTP-7000分杯处理系统
样本提取:
MGIEasy粪便基因组DNA(人源)提取试剂盒、MGISP-NE384全自动核酸提取纯化仪
注:灰色部分的内容仅作为下游应用的举例说明,华大智造MGIEasy粪便基因组DNA(人源)提取试剂盒及其配套自动化设备助力于打造样本前处理一站式平台
Round 1自动化分装 PK 手工分装>>结果显示:所有的CT值都在37以内,而且集中在参考线上,说明最后提取得到的结果一致性好,即自动化分样效果可以达到手工分装的水平,可以大大减少人员接触样本的时间,提高操作人员的舒适性和安全性。
注:1)CT≤37表示人源DNA检出;2)参考线代表检测同一样本CT值一致
Round 2
自动化分装重复测试>>结果显示:所有重复都很好的实现人的DNA的提取,而且重复性高,一致性好,说明通过搭配分杯系统MGISTP-7000和全自动提取系统MGISP-NE384,可以实现高度自动化,且提取稳定性高。
注:1)CT≤37表示人源DNA检出;2)参考线代表检测同一样本CT值一致。
大规模肠癌早筛样本前处理
一站式平台选择建议:
•年样本量<5W人份
注:1)时间上包含了手工操作时间,离心需自配离心机;2)灰色部分的内容仅作为下游应用的举例说明,华大智造MGIEasy粪便基因组DNA(人源)提取试剂盒及其配套自动化设备助力于打造样本前处理一站式平台
一站式平台选择建议:•年样本量>5W人份
注:1)时间上包含了手工操作时间,离心需自配离心机;2)灰色部分的内容仅作为下游应用的举例说明,华大智造MGIEasy粪便基因组DNA(人源)提取试剂盒及其配套自动化设备助力于打造样本前处理一站式平台
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产品信息
产品名称 | MGIEasy 粪便基因组 DNA(人源)提取试剂盒 |
提取方法 | 磁珠法 |
有效期 | 12个月 |
存储条件 | 2℃~30℃ |
样本类型 | 新鲜和冷冻的人类粪便 |
样本采样量 | 180-220 mg |
洗脱体积 | 100-150 μL |
适配的自动化 | 高通量自动化样本制备系统MGISP-960,96样本/轮 高通量核酸提取系统MGISP-NE384,384样本/轮 |
提取时间 | 手工:~ 90 min MGISP-960:~ 90 min MGISP-NE384:~60 min |
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