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干货|如何玩转WB实验

上海钰博

2021/10/14 16:19

阅读:217

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免疫印迹

免疫印迹(Western blot,WB)是蛋白组学中检测复杂生物提取物中特定蛋白质存在的最常用方法之一,WB先要进行SDS-PAGE,然后将分离的蛋白质样品用电转仪转移到固相载体上,而后,利用抗原-抗体-标记物显色来检测样品,可以用于定性和半定量,

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免疫印迹(WB)实验流程

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【免疫印迹(WB)实验流程图】


一、蛋白提取


1.细胞样品在提取前需要使用PBS清洗两遍,以减少培养基对样品的干扰,悬浮细胞可500xg低速离心后收集进行蛋白提取,贴壁细胞可再培养皿中进行蛋白提取。

2.组织样品在提取前需要PBS清洗,一些含血量丰富的组织,建议使用红细胞裂解液去除红细胞,

3.为防止蛋白降解、去磷酸化,各种蛋白酶抑制剂、磷酸酶抑制剂都是必须的

4.在提取蛋白的时候仅仅靠裂解液有时候也不能达到完全抽提的效果,有条件的话,可以对抽提悬液进行超声破碎处理;

5.如果没有裂解buffer,可以用1xSDSloading buffer代替来抽取蛋白,不过抽提后的样本不能进行浓度测定,

6.蛋白煮沸变性一般是95-100°C,5-10min,水浴锅煮沸时,可以用带夹EP管防止EP管盖弹开,使水浴锅内的水进入而使样品废掉,
二、蛋白电泳


1. 玻璃板清洗后,为了使表面的水快速晾干,可以在烘箱中放置几分钟,拿出来的时候后需平衡至室温再灌胶,不然很容易产生气泡;


2. 配胶用的试剂一般都是在4度冰箱保存,当我们按比例配好混合液的时候,要等混合液恢复室温时,再灌胶,不然也很容易产生气泡;


3. 玻加水液封时,速度要慢,可用1ml枪沿着胶板上沿反复移动,不然很容易将分离胶冲变形;


4. 梳子注意和玻璃板匹配,1.5mm的梳子很难插进1mm的玻璃板中,暴力插入会破坏胶板;如果1mm的梳子插到了1.5mm的玻璃板中,由于中间有空隙,就会有胶凝固在里面;


5. 浓缩胶凝好可以泡到电泳缓冲液里,比较容易拔出。

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三、蛋白转膜


1.蛋白因结合SDS而带电荷,在电场下从胶中转至膜上,转膜操作根椐电转仪制造商的说明书进行转膜方式分为半干和湿转两种,半干式转膜速度快,而湿式成功率高并特别适合用于分子量大于100KD的蛋白。

2.湿式转膜三明治排列为:海绵/纸/胶/膜/纸/海绵,全部紧密排列,特别是胶/膜之间不能留有气泡,三明治安放的方向确认正确负极方为带负电的胶里的蛋白,向正极方(膜)电迁移。标准的电转缓冲液为1X Tris-glycine buffer 不含SDS,但加入20%甲醇,如果转膜的蛋白分子量大于80KD,则推荐加入SDS使之终浓度为0.1%。

3.半干式转膜中,三明治的排列为:/纸/胶/膜/纸,用电转缓冲液浸湿后,直接置于电转仪的正负极之间。胶于负极而膜置于正极。半干式的电转缓冲液可不同于湿式的电转缓冲液,推荐为:48 mM Tris, 39 mM glycine, 0.04% SDS, 20%甲醇,

4.两类膜可供选择:硝酸纤维素膜和PVDF膜(正电荷尼龙膜),根据不同需要选择(下表),PVDF膜需要浸泡甲醇中1-2分钟,再孵育于冰冷的电转缓冲液中5分钟,胶也需在冰冷的电转缓冲液中平衡3-5分钟,否则转膜时会导致条带变形。

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四、大蛋白(大于100KD)


1.对于大蛋白而言,其在凝胶电泳分离迁移较慢,而从凝胶转出也非常慢,因此对于这种大分子量蛋白应该用低浓度的凝胶,8%或更低,但因低浓度的胶非常易碎,所以操作时需十分小心,

2.大蛋白易在凝胶里形成聚集沉淀,因此;转膜时在电转移缓冲液加入终浓度为0.1%的SDS,以避免出现这种情况,甲醇易便SDS从蛋白上脱失,因此应降低电转移缓冲液中甲醇的浓度至10%或更低,以防止蛋白沉淀。

3.降低电转移缓冲液中甲醇的比例以促进凝胶的膨胀,易于大蛋白的转出。

4.如果使用PVDF,甲醇是必需的,且转膜前PVDF需用甲醇活化。但如果是NC膜,甲醇可以不必加入电转移缓冲液中。

5.选择湿式,4 ℃转膜过夜,以取代半干式转膜。


五、小蛋白(小于100KD)


1. SDS妨碍蛋白与膜的结合,特别是对小蛋白更是如此,因此,对于小分子的蛋白,电转移缓冲液中可以不加SDS。


2.保持20%的甲醇浓度
六、膜的封闭


1. 脱脂奶是最常用的经济配方。


2. 脱脂奶粉不能与生物素化的抗体一起使用,因为脱脂奶粉含有糖蛋白和生物素;建议使用BSA。


3. 分析磷酸化蛋白须用BSA。脱脂奶粉含磷酸酶,用磷酸化特异性抗体分析磷酸化蛋白受到影响,因为磷酸酶与膜上的磷酸化蛋白接触可使之去磷酸化;也不适用于碱性磷酸酶(AP)检测系统。


4. 如果用辣根过氧化物酶(HRP)检测系统,封闭液不应加叠氮钠(NaN3),因为叠氮钠对辣根过氧化物酶(HRP)有灭活作用。


5. 如果用二抗抗体是碱性磷酸酶(AP)标记的检测系统,可使用酪蛋白封闭,同时须选择TBS缓冲溶液,不可使用PBS缓冲溶液,因为PBS缓冲溶液干扰碱性磷酸酶。


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七、一抗二抗孵育


按抗体说明书建议的稀释倍数,用TBST稀释一抗,如果说明书没有建议的稀释倍数,则参照一般推荐的稀释倍数(1:100-1:3000),一抗浓度过高会导致产生非特异性条带。

选择二抗抗体取决于一抗抗体的动物来源,

建议使用商品化的抗体稀释液稀释一抗二抗,不仅能有效减少一抗或二抗的非特异性结合,并有效提升稀释后抗体的稳定保存时间,可重复利用,
八、显影成像


1.建议使用高信号、高灵敏度,高稳定性的化学发光试剂

2.显影液覆盖整个印迹膜,

3. 将显色液从冰箱拿出,注意避光,将A液,B液按照等体积混合,一般一张膜用量1ml,用枪均匀滴在膜表面,剪开一个自封袋,用镊子把膜平整放在自封袋中,压好,避免产生气泡,放在光片夹中。



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