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亚硫酸氢盐修饰后测序法检测甲基化

2019/10/18 16:20

阅读:190

分享:
应用领域:
生物产业
发布时间:
2019/10/18
检测样品:
其他
检测项目:
亚硫酸氢盐修饰
浏览次数:
190
下载次数:
参考标准:
亚硫酸氢盐修饰后测序法主要可用来检测甲基化。

方案摘要:

重亚硫酸盐使DNA中未发生甲基化的胞嘧啶脱氨基转变成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不变,用PCR扩增(引物设计时尽量避免有CpG,以免受甲基化因素的影响)所需片段,则尿嘧啶全部转化成胸腺嘧啶。最hou对PCR产物进行测序,并且与未经处理的序列比较,判断是否CpG位点的甲基化状态。

产品配置单:

所需试剂

亚硫酸氢钠7631-90-5

型号:

产地:

品牌: 远慕

面议

参考报价

亚硫酸氢钠溶液(10%)

型号: 500ml

产地:

品牌: 远慕

¥1

参考报价

亚硫酸氢钠溶液(0.5%)

型号: 100ml

产地:

品牌: 远慕

¥1

参考报价

乙二醛亚硫酸氢钠化合物外水合物332360-05-1报价

型号: 50g

产地:

品牌: 远慕

¥1

参考报价

方案详情:

实验目的: 亚硫酸氢盐修饰后测序法主要可用来检测甲基化。

 

实验原理: 重亚硫酸盐使DNA中未发生甲基化的胞嘧啶脱氨基转变成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不变,用PCR扩增(引物设计时尽量避免有CpG,以免受甲基化因素的影响)所需片段,则尿嘧啶全部转化成胸腺嘧啶。最hou对PCR产物进行测序,并且与未经处理的序列比较,判断是否CpG位点的甲基化状态。

 

实验材料 :DNA

 

试剂、试剂盒     

NaOH

苯二酚(氢醌)

亚硫酸氢钠

石蜡油

 

仪器、耗材  

离心管

恒温水浴锅

铝箔纸

 

实验步骤

1.将约2ugDNA1.5mlEP管中使用DDW稀释至50ul

2.5.5ul新鲜配制的3M NaOH

3. 42℃水浴30min

 

水浴期间配制:

4.10mM对苯二酚(氢醌),加30ul至上述水浴后混合液中;(溶液变成淡黄色)

5. 3.6M亚硫酸氢钠(SigmaS9000),配制方法:1.88g亚硫酸氢钠使用DDW稀释,并以3M NaOH滴定溶液至PH 5.0,最终体积为5ml。这么大浓度的亚硫酸氢钠很难溶,但加入NaOH后会慢慢溶解,需要有耐心。PH一定要准确为5.0。加520ul至上述水浴后溶液中。

6.EP管外裹以铝箔纸,避光,轻柔颠倒混匀溶液。

7.200 ul 石蜡油,防止水分蒸发,限制氧化。

8.50℃避光水浴16h

 

注意事项     

避免化学品或外源DNA的污染。

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