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染色质免疫共沉淀(ChIP)技术

北京德泉

2022/02/15 18:39

阅读:69

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什么是ChIP技术?

1.1简介

染色质免疫共沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation, ChIP)是一种检测在体内自然染色质环境下蛋白和DNA相互作用的有效方法。这种技术广泛应用于检测特定基因调节蛋白结合在基因组中的具体位置或者基因调节区域和蛋白的修饰是否相关。。因其能真实、完整地反映结合在DNA序列上的靶蛋白的调控信息,是目前基于全基因组水平研究DNA-蛋白质相互作用的标准实验技术,日益成为研究真核细胞中转录调控情况的重要途径。

1.2技术原理

在活细胞状态下,通过在特定时间点上用甲醛交联等方式固定蛋白质-DNA 复合物,相当于这一时间点上细胞内蛋白和DNA相互作用的关系被瞬时“快照(snapshot)”下来。并将其用Bioruptor超声波破碎仪随机超声打断为一定长度的染色质小片段,然后通过免疫学方法将蛋白质-DNA复合物与特定DNA结合蛋白的抗体孵育,将与抗体特异结合的蛋白-DNA复合物洗脱下来,最后将洗脱得到的特异DNA与蛋白解交联,得到特异性地富集目的蛋白结合的 DNA 片段,通过对DNA片断的纯化与检测,从而获得蛋白质与 DNA 相互作用的信息。

1.3适用研究

1.31 筛选调控蛋白在基因组上的结合靶点:针对转录因子、DNA/RNA 聚合酶、转录复合物等调控因子蛋白进行特异性的富集,分离纯化与之结合的靶 DNA 片段并测序,分析筛选到准确有效的靶位点、靶基因数据;

1.32 揭示差异化表观遗传变异的原理:通过对不同表型组织内组蛋白、转录因子蛋白及其他结合蛋白进行染色质免疫共沉淀测序并定量分析靶基因表达调控水平或针对同种组蛋白进行甲基化、磷酸化、泛素化修饰所导致的结合位点变异进行分析,即可准确揭示差异化表观变异原理;

1.33研究表观遗传变异疾病:借助染色质免疫共沉淀测序技术结合生物信息分析揭示由蛋白与 DNA 相互作用变异而引起的疾病的原理,明确表观遗传修饰在癌症等表观遗传变异疾病的发生发展过程中的具体作用机制。

1.4超声打断为何推荐要使用Bioruptor超声波破碎仪


比利时Diagenode生产的Bioruptor plus非接触式细胞破碎仪,其超声源是一块附着在水槽下面的半导体金属块,绝非普通的压电陶瓷。其独特的ACT( Adaptive Cavitation Technology) 聚焦超声技术以及高效的超声效能,能快速处理各种样品,得到满意的超声结果。


仪器可选配1.5ml适配器(如上图),可同时处理6个样本,适配器中每个样本的填装体积以及浓度,更是针对ChIP或ChIP-seq技术特别优化过的,与实验室所需的上样量与上样浓度完全衔接,符合实验室需求。

自带电磁阀式冷循环机,与超声仪主机交错启动,可保证在处理测序DNA或chromatin样本片断化时,让样本处于恒定冰冷水浴条件下,同时完全不干扰超声波传到到样本的效率,其高性价比、高通量、高功率、低干扰的优异设计,都是为了让实验的结果更正确、重复性更佳。

此外更考虑到实验与应用的多元性,厂家特别设计出适合极小量样本的0.65ml适配器,一次可以处理12个样本,是市面上能处理体积最小的适配器,完全是让珍贵样本也能进行ChIP实验特别订制的,也彻底解决了无法处理微量珍贵样品进行ChIP或测序实验的困境。

仪器还含有自动过热断电保护及仪器寿命监控系统,可确保仪器在操作过程中的正常运作以及保护测序样本不过热产生质变的危险,可让仪器正常使用情况可超声效率维持长久不衰减。


北京德泉兴业商贸有限公司为Diagenode授权代理商。

Bioruptor厂家提供了各种实验的方案技巧,可以官网免费下载,或者联系代理商获取,减少因为摸索超声条件而浪费了得之不易的样本。


北京德泉兴业是一家以代理进口实验室仪器为主的专业设备公司,自成立以来,一直致力于提升国内实验室硬件水平以及为客户提供高效的实验解决方案。


德泉兴业的经营范围涵盖了生命科学、理化分析、生物制药以及当下最为关注的食品安全和环境保护,为高校、医院、科研院所等提供优质产品和服务。


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