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《自然》：如何消除基因数据的不一致

2013/05/18 07:54

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2013/05/18

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《自然》：如何消除基因数据的不一致来自美国范德堡大学的研究人员发表了题为“Inferring ancient divergences requires genes with strong phylogenetic signals”的文章，针对不同基因树之间存在的不一致性展开了探讨，指出要消除不一致性需要的两大依据。这一研究成果公布在5月16日的Nature杂志上。领导这一研究的是范德堡大学Antonis Rokas博士，其研究组主要研究方向是基因组系统分类，曾参与研究报道称，生物进化并没有选择特殊蛋白的偏好密码子。虽然第一个基因组是在10年前的测定，但是基因组已经对系统分类有了很大的影响。基因组数据使研究人员发现了建立生物之间早期关系的新的标记。大量的数据给系统分类建设的推断以更多的信心，但也带来了挑战。研究人员需要更大的计算机和新的统计算法来处理这些数据。有些棘手的问题也变得更清楚，包括某些基因历史看起来更像进化网络而不是树。比较基因组学将使可以得到的分子数据极大地增加，从而在组建一个更清晰的生命之树上起关键作用。为了解决不同基因树之间存在的不一致性问题，在这篇文章中，研究人员对来自23个酵母基因组的1,070个同源基因进行了系统基因组分析，发现这1070个基因树中与从级联分析得到系统亲缘关系均不一致。而且这种不一致性会随着系统更深入，节点更短，而程度更大。

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