系统配置:
■ Illumina Hiseq 2500基因测序分析系统
这台仪器状况良好,已经在SpectraLab Scientific进行了测试。
所有套件和组件均包含90天保修。
技术参数:
1、高数据通量:每次仪器运行读取高通量模式可在6天内生成1T碱基数据,或用使用快速模块在27小时内产生120G碱基数据。
2 、实验时间:常规模式下单端读取2.5天,双端读取11天,快速模块下双端读取27个小时(根据测序长度略有变化);
3、数据读长:常规模式单端读取序列,读长大于100个碱基;快速模式单端读取序列,读长大于150个碱基
4、双端读取序列:常规模式读长大于2x100个碱基,快速模式读长大于2x150个碱基
5、样品用量:DNA样本需要0.1微克
6、读取精度:原始数据准确性≥98.5%,3倍覆盖拼接序列准确性≥99.99%
7、可精确读取≥12个的连续单个重复碱基(如AAAAAAAAAAAA),准确性≥99%
应用范围:
每次运行可选择高通量(6天1T数据)或快速(27小时120G数据)模块,可以满足基因组研究的绝大多数应用。对DNA,RNA,表观研究都有配套的方案。具体应用:
1、未知物种基因组的从头测序
2、已经测序物种的基因组重新测序
3、基因组尺度转录组学分析(Transcriptomics)
4、基因表达谱及基因调控研究
5、全基因组小分子RNA(miRNA)分析
6、染色质免疫互沉淀研究(ChIP)
7、多重单核苷酸多型性(SNP)分析
8、甲基化研究
9、其他表观遗传学研究如磷酸化修饰
10、蛋白-DNA相互作用研究
11、染色体重排研究(缺失,插入等等)
Spectralab在分析设备方面拥有专业知识。欢迎您与我们的专业团队进行联系,您的任何咨询我们都会及时进行回复。
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