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希伯来大学-3D水凝胶单细胞培养研究
希伯来大学-3D水凝胶单细胞培养研究
这是微纳立方第32篇微流控推文。
Bavli等人基于液滴微流控技术，研发了一种名为“CloneSeq”的高灵敏单细胞分析平台，可用于3D细胞培养的全面表征，揭示了新的癌症特异性亚群的存在，并于2021年在Dev. Cell期刊发表论文（影响引子12.861，论文链接见文末）。
（科学家和他们的微流控实验平台：为了实现稳定又精确的微流体控制，获取误差最小的数据，他们采购了几十个法国Fluigent的压力泵、流量计和旋转阀等部件，搭建了一套通用型微流控综合实验平台）
Bavli等人的实验大致可分为两步：
第1步，在3D水凝胶中完成单细胞的封装，并进行克隆扩增，流速范围为8至34μL/min，每秒生成700个水凝胶微球。
（水凝胶单细胞封装方案示意图）
（单细胞封装与克隆示意图）
第2步，进行克隆分析，作者设计了另一种微流体方案来捕获微滴中的克隆，并使用InDrops protocol对其进行条码化。
（InDrops protocol的微流体方案）
（捕捉到的图像：Single Clone和Barcode Bead被封装于同一微滴）
实验完成后，作者使用Fluigent十转一阀门M-Switch清洗方案，自动完成实验仪器和管路的清洗。
论文：Bavli, D. et al. CloneSeq: A highly sensitive analysis platform for the characterization of 3D-cultured single-cell-derived clones. Dev. Cell (2021).
DOI: 10.1016/j.devcel.2021.04.026
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