第18期分享讨论: 磁珠提取纯化系统的应用
昊诺斯第18期组织研磨和样品处理分享、讨论,我们邀请到了昊诺斯产品经理给大家分享,内容是——磁珠提取纯化系统的应用。
昊诺斯嘉宾:
大家好,借着我们这个研磨仪交流平台,我们之前分享了磁珠提取纯化系统,上次的分享我们重点放在了工作原理上。大家对于我们这台磁珠提取纯化系统仪器的工作原理还有什么问题吗?
昊诺斯用户:
原理上没多大问题了。
昊诺斯嘉宾:
应几位老师的要求,本次我们总结整理了关于这台磁珠提取纯化系统仪器的应用方向和大家来分享一下。老师能够用到我们的研磨仪,那么我想问下大家,研磨后接下来你们都做哪些方面的实验?
昊诺斯嘉宾:
我想下游的很多实验要做的就是核酸提取,那么我们这款磁珠提取纯化系统,能做的最常见的实验就是提取dna、rna、蛋白,也适用于提取细胞,很好的契合了您研磨仪的下游实验。
昊诺斯用户:
嗯,早些天我才弄清楚研磨仪的后续是为了做dna提取,进行pcr分析。
昊诺斯用户:
研磨样品做化学分析可以吗?比如食品添加剂苯甲酸,农残分析?
昊诺斯嘉宾:
这些应用都是我们在认识这台磁珠提取纯化系统仪器最初的一个印象,但是其实我们这台磁珠提取纯化系统能够应用的领域特别的广泛。
昊诺斯嘉宾:
针对史老师的问题,我稍后也会有应用针对您的实验需求。先回答您一下,对于农残分析,我们这台磁珠提取纯化系统仪器是很好的一台仪器,完全可以用的上,并且您帮你提高实验通量。
昊诺斯用户:
嗯!这样应用就比较广了。
昊诺斯嘉宾:
以下这些是我们对于这台磁珠提取纯化系统的一些应用汇总:生物样本库、无创产前检测、个体化用药研究、临床分子检测、病理分子诊断、分子流行病学研究、血液成份研究及血筛、基因表达水平分析、药物基因组学、蛋白组学研究、法医学鉴定、刑侦检测、高致病性微生物监测、兽医监察及动物疫病监测、食源性微生物检测、食品安全监测及风险评估、食品转基因检测、种子真实性及纯度检测、环境污染及微生物监测、动植物分子育种研究、基因工程研究、生物制品核酸残留检测、噬菌体淘洗。
昊诺斯嘉宾:
随着实验技术,以及检测手段的升级,我相信,我们这个磁珠提取纯化系统的应用会越来越多。大家可以对应自己的研究领域,来看一下,我们这款磁珠提取纯化系统仪器,能不能帮到您。
昊诺斯嘉宾:
上面我列出了应用领域,可能很多老师会问,这个领域会用到的仪器很多,那么你这款磁珠提取纯化系统仪器到底会用到我的实验哪个环节,那么接下来,我会有针对性和大家来分享,我们这款磁珠提取纯化系统仪器到底能应用到哪些具体实验中。
昊诺斯嘉宾:
那么我们先从我们每个人都关心的医疗健康领域说起。
昊诺斯用户:
是不是研磨仪研的越细,提取效率越高,化学物质也有提取效果?
昊诺斯嘉宾:
游离核酸提取——产前诊断。胎儿的基因片段会透过胎盘进入母体的血液循环,可以利用这些游离于血液中的基因片段,进行无创产前诊断(无需羊膜穿刺),以了解胎儿的生理状态及有无单基因遗传病。应用kingfisher及血液游离核酸试剂盒可以从全血、血浆中快速提取游离于血液中的基因碎片,产物可以用于qpcr检测或高通量测序产前诊断。
昊诺斯嘉宾:
史老师这个问题,我先回答一下,其实并不是像您说的这样,研的越细,提取效率越高。因为我们研磨的时间,以及研磨过程中对核酸片段的损伤,我们也要考虑在里面。因为很多分析,我们也需要长片段,那么你研磨的细,无外乎两种方式来研会很细,一种我增加研磨实验,一种我们加大研磨力度,那么这两种方式,时间会造成核酸的降解,力度会损伤片段,所以我们需要找到一个合适的时间,以及适度的力度。
昊诺斯嘉宾:
那么我们继续分享我们的磁珠提取纯化系统的应用,血液游离dna提取——癌症早期诊断。现如今癌症已经成为我们人类的一大杀手,怎么能更早发现,已经确诊癌症,也成为我们的一个研究重点,研究发现,很多癌症在发病早期会释放很多细胞因子包括dna片段到血液中,这些游离短片段核酸就可以作为癌症早期诊断的标记物,用于癌症发病早期诊断。那么用分子的检测手段,不但能及时,且能准确的帮助我们及早发现癌症的发生,那么对于癌症病人来说,越早发现,更得得到好的救治。
昊诺斯用户:
胎儿的基因片段能够通过胎盘进入母体血液?
昊诺斯嘉宾:
是的,现在很多产前诊断都是通过检测母体的血液样本中的游离核酸做到的。
昊诺斯嘉宾:
我们群里有位薛老师,我不知道薛老师在没在看我们的本次分享,薛老师是贝瑞和康的一位工作人员,贝瑞和康在产前诊断这一块,就已经做到了很成熟的应用我们的磁珠提取纯化系统,我们这台磁珠提取纯化系统仪器,帮助贵公司实现了高通量的产前诊断。
昊诺斯嘉宾:
除了我们刚才说到的产前诊断,癌症早期诊断,那么我们现在还有很多其他疾病,那么现在多重分子诊断,也成为了现在诊断方面的一个热门。高灵敏度病毒检测,极大缩短了检测、诊断时间。为病毒病诊断、输血术前四项等应用提供便捷快速的核酸提取手段。
昊诺斯嘉宾:
我国是一个肝炎携带者比较多的一个国家,以前我们都是采用elisa方法来检查,那么有了高通量的磁珠提取纯化系统,核酸检测方法相对传统elisa方法具有速度更快、灵敏度更高的优势。我们常见的临床病毒检测还有:hbv临床检测-从血清样品中提取病毒dnah1n1临床检测-从人的咽拭子标本提取病毒rna、hbv临床检测-从血清样品中提取病毒dna、h1n1临床检测-从人的咽拭子标本提取病毒rna、ebv临床检测-从人血浆样品中提取病毒dna、单基因遗传病产前诊断(如:地中海贫血,遗传性耳聋及一针至聋,hla骨髓配型实验,胎儿的耳聋筛查已经作为一项孕检的必检项目)、临床分子诊断(如:肿瘤组织、细胞dna提取-癌症诊断,石蜡包埋样品dna提取)、高通量病毒检测及疫情监控(如:高发、突发流行病检测(h1n1、h5n7、h7n9,可30分钟一次提取96个样本),粪便标本提取norovirus rna)、常见传染病检测(如:传染病诊断—结核分枝杆菌)。
昊诺斯嘉宾:
我刚才给大家分享了一些临床上我们能应用到我们这台磁珠提取纯化系统设备的一些领域。
昊诺斯用户:
早些天我去医院做唐筛,也是这个原理吧。
昊诺斯嘉宾:
是的,一般唐筛都是这么做,如果检测有疑似的话,会建议再做羊水穿刺,因为羊水中游离的胎儿的核酸片段更多,所以进一步检测的话,一般都会做羊水穿刺。希望有做这方面的老师,也可以帮我们做一些补充分享。如果大家没有问题,那么我这边继续做我们今天的分享,如果有问题,可以随时发出来。
昊诺斯嘉宾:
我们昊诺斯区域主要放在科研和大学,所以我们群里用户应该是这些领域的偏多,那么我们说一说,畜禽病监控:动物疫病分子诊断——牛病毒性腹泻病毒。牛病毒性腹泻病(bvd),是由牛病毒性腹泻病毒(bvdv)引起的一种极为复杂、有多种临床表现的疾病。该病毒可感染牛、猪、羊、鹿等动物,给畜牧业造成重大的经济损失。德国政府自2004年开始监控bvdv病毒引起的牲畜感染,2007年通过的bvdv保护条例规定:bvdv病毒是养牛业的必检项目。采用专利的kingfisher技术和invimag病毒rna提取试剂,可进行bvdv病毒的快速分子诊断。仅在德国萨克森一地,每年就有20万头牲畜接受该方法的检测,在我们国内这项工作可能还没有作为强制检测项目,但是我相信,未来我们国家会建立这样的检测机构和部门,来做这件事情。
昊诺斯嘉宾:
环境样品监控。在疫情暴发期及非暴发期的日常环境监控中,kingfisher同样可用于诸如禽流感、猪流感、猪蓝耳病、口蹄疫等繁养殖动物的疫情监控,以及日常环境监控样品如环境拭子、粪便拭子等的病毒na提取。便于疫情及非疫情期病的病原监控,以防止疫情扩散。当有疫情发生,我们这台磁珠提取纯化系统仪器能及时快速的帮助疾控人员做到快速,精准的锁定疫情。
昊诺斯嘉宾:
除了疾控方面,食品安全也越来越成为我们关注的热点,那么我们又能做哪些工作呢?植物dna提取(如:食品转基因检测,种子真实性检测)、食品安全检查{如:食用油食品安全检测、大豆油转基因检测、假牛羊肉、名贵中药材、深加工食品(果脯、糖浆浸泡的蜜饯、嘉应子、发酵的豆酱面)、免疫磁珠—食品微生物富集及dna提取}、刑侦学应用:干血、毛发、烟嘴等。我想这个是刚才史老师问到问题,这里给您做详细解答。
昊诺斯嘉宾:
除了核酸方面的应用,那么我们这台磁珠提取纯化系统仪器还可以做很多其他方面的应用,我现在给大家列举几个。免疫磁珠—食品微生物富集及dna提取,经过特殊处理的dynal免疫磁珠可以快速地从食品样品、环境中富集致病菌,如沙门氏菌(salmonella)、李斯特菌(listeria)、军团菌(legionella)、大肠杆菌o157(e. coli o157)、贾地鞭毛虫(giardia cysts)和隐孢子虫(cryptosporidium oocysts)等。采用磁珠提取技术可以有效地富集样品中的微生物,减少背景干扰从而提高实验的重复性和准确性,该方法已获美国环保署(epa)和美国官方分析化学师协会(aoac)的认可。
昊诺斯嘉宾:
药物筛选与研发如:加速噬菌体展示文库的淘洗进程,先导化合物标记与分离/重分离,血清中肽段表达谱研究与生物标志物筛选生物制药质量检测,如:重组药物/疫苗宿主dna残留检测、血液制品病毒残留、法医数据库的应用土壤dna提取、海洋植物dna提取等。
昊诺斯嘉宾:
这些内容可能涵盖了我们这台磁珠提取纯化系统仪器的一部分功能,还有很多其他方面的应用,希望大家在以后得研究中给我们更多的反馈。这台磁珠提取纯化系统仪器简而言之,就是一个取代人手工的机器,它的应用远不止这些,希望大家把您的研究过程中遇到的问题,与我们分享,我们共同来发掘它更多的应用。今天我的分享就是这些,欢迎各位老师批评指正。
最后,让我们共同期待第19期“组织研磨和样品处理分享、讨论”活动吧!下期,我们不见不散!
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本群的目的是希望可以给大家提供一个样品处理问题的交流平台,有什么相关问题在群里能够分享和提问答疑̷̷另外我们还能通过这个平台连接用户使用人员和工厂研发人员,看看在这些讨论过程中是否会碰撞出火花来,以为实验室手工的样品处理做出更多更好的自动化的辅助工具或替代仪器备来,更可以为完善我们现有产品的设计打开思路提出建议̷̷
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