【干货分享】昊诺斯第九期“组织研磨和样品处理分享、讨论”
这一期我们为大家提供的案例是“石榴皮研磨提取RNA”:
实验:石榴皮研磨提取RNA
实验地点:武汉某生物公司
试验样品:石榴皮样品
1、将石榴皮剪成小碎块冻存,实验时取出放入圆底离心管,单管放入体积不超过离心管体积的1/3;
2、在离心管中加入硬质不锈钢研磨珠,盖好管盖,与适配器一起放入液氮然后取出;
3、将取出后的适配器安装在TL2010S中通量组织研磨仪上,参数设置为一定转速,研磨一定时间。
在昊诺斯销售工程师对以上案例简单讲解之后,用户们在“昊诺斯鼎昊源组织研磨分享”群内进行了热烈的分享、讨论:
用户:石榴皮含有果胶吧?
昊诺斯:应该含有少量果胶,其实石榴皮也算是植物样品中的一类。
用户:果胶纤维素的存在对检测过程有影响吗?
昊诺斯:研磨的方法与研磨叶片相同。
用户:我看看。
昊诺斯:应该不会有影响,现在的RNA提取试剂还是挺成熟的。
用户:时间不一样吧。
昊诺斯:您是说研磨时间?
用户:嗯,知道了,还有提取试剂存在。
昊诺斯:石榴皮冻过液氮以后还是很好研磨的。
用户:前面的负八十有必要吗?后面直接液氮了?
昊诺斯:前面的-80是保存样品。
用户:前面的负八十有必要吗?后面直接液氮了?我也有同样的疑问。
用户:负八十是为了降低空气体积吧,免得液氮时爆开。
昊诺斯:这个使用的客户也是服务公司,样品都是别的客户提供的。
昊诺斯:也有这方面的原因。
用户:液氮的温度是多少度?
用户:我想问管和钢珠需要depc水处理吗?
昊诺斯:负一百九十多。
用户:这个是必须的吧,196。
昊诺斯:如果提取的是RNA,是必须处理的。
用户:那我想问问有没有替代离心管的适配器?我一用就裂管。
用户:换管子材料吧,能禁得起冷冻的。
用户:你们用哪一种牌子的?
昊诺斯:我们的经验是选用圆底2ml离心管,减少液氮冷冻时间,缩短组织研磨仪研磨时间,或者换个牌子的离心管。
用户:我都试过了,就在组织研磨仪研磨后发现裂了,所以想问问你们用什么牌子。
昊诺斯:哪位老师用的管效果还可以,可以介绍一下。
用户:我们用的一直都不错,也出现过裂管。
昊诺斯:据用户说这款的不错。
昊诺斯:还有eppendorf的。
用户:进口的?无须灭酶了?
用户:然后就调低组织研磨仪转速1000吧,延长打样时间。
昊诺斯:进口的,第一个是Thermo的。
用户:其实我个人觉得RNA也没有想象的那么恐怖。
用户:哦哦,谢啦。
用户:三无的管子。
用户:裂管是因为温差变化太大么?
用户:就是不清楚。
用户:有个疑问啊,DNA和RNA能实现分离吗?
用户:钢珠用酒精泡泡,提的RNA就OK。
用户:组织研磨仪能否控温?
昊诺斯:现在好像有种提取液可以实现。
用户:管子裂是因为液氮下塑料变得脆了,然后高速钢珠一冲撞就裂了。
用户:为什么要分离呢?样品很珍贵?
用户:您的意思是先提取DNA,然后继续利用提取完的原材料来提取RNA?
用户:塑料材质达不到低温保护。
用户:提完分别用对应的酶处理这样技能保证量也能保证质。
用户:不是,我的意思是两者有没有分离干扰?
用户:用trizol说明书上说是可以DNA和RNA分离。
昊诺斯:应该是没有,之前我问过一个客户,用组织研磨仪研磨一次,用特定的提取液,可以同时提取DNA和RNA。
用户:同一样品可以同时提取。
用户:提 RNA不如DNa省事。
用户:我们打样裂过后采取的措施第一减低组织研磨仪转速,打样后然后再冻再打,延长打样时间;二把样品分装两管打样后加上TRIZON再合并。
用户:嗯,看来提取剂的选择性已经非常高了。
昊诺斯:您可以先降低下组织研磨仪研磨速度,比如1900转或者1800转,试下。
用户:我用的是1700。
用户:速度关系不大,是温度导致的。
用户:那如何是好?
用户:只能换管子材料。
昊诺斯:嗯嗯,就像吕老师说的,可以研磨比如30s,取出后再冻液氮,然后再磨,少量多次。
用户:国外进口的不知道现在怎样,之前也碎过好几个,把老板心疼坏了。
昊诺斯:进口的应该效果会好一点,毕竟国内的良莠不齐。
用户:当时还不是研磨,只是离心。
用户:有个疑问:离心管有金属材料的么?
用户:感觉应该有,但没见过。
昊诺斯:我们有5ml不锈钢的研磨管。
用户:容积大的我们也有,但是1.5的没见过。
用户:304材质的可以,耐低温和高温。
用户:不锈钢的成本太高吧,会不会引进交叉污染?
用户:但是不锈钢的可以重复使用呀,灭菌即可。
昊诺斯:清洗消毒干净,应该不会交叉污染。
用户:304的很耐操的。
昊诺斯:304很耐腐蚀。
昊诺斯:盖是什么材质的?
用户:标配是聚乙烯,可选配硅橡胶。
用户:应该挺成熟了。
用户:现在可以适配上这个机器吗?
昊诺斯:看介绍和2ml离心管的尺寸一样,应该可以。
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