畅享小分子互作分析！

我们之前统计了第一季度的国内Octet文章，第二季度继续发力，陈老湿下载到了近70篇，去除预印版和综述，归纳了近50篇文章的单位和应用。

可见，有至少40个单位用到了Octet，其中中国药科大学是Q2发表最多的单位，另外复旦大学、武汉病毒所、东北师大、中国海洋大学等也发表了多篇文章。

从应用方向来看，依然涉及到了多个应用，而小分子+多肽应用文献数量超过了1/3，是Q2文章中最多的应用。足以说明Octet不仅简单易用可以短时间内获得动力学数据，而且具备足够的灵敏度来测试小分子。今天陈老湿就带大家畅游这些小分子文章。


高亲和力小分子测定[1]
单位：大连理工大学

• 小分子：LFS-31，莱菔素类似物
• 靶点：chromosomal maintenance 1 (CRM1, exportin-1)
• 潜在适应症：乳腺癌为主
• 实验方法：Octet RED96e，SSA固化蛋白，检测小分子，结合解离各3分钟
• Octet：KD = 43.1 nM
• 机理：增加IκBα在细胞核内的滞留，防止诱导降解信号通路
• BLI原始数据：

陈老湿点评：
该小分子化合物亲和力在几十nM，灰常不错了，最高浓度几百nM就可以了。



共价化合物亲和力测定[2]
单位：中国药科大学

• 小分子：withangulatin A (WA)，天然产物
• 靶点：Phosphoglycerate Dehydrogenase (PHGDH)
• 潜在适应症：肿瘤
• 实验方法：Octet RED96，NTA固化蛋白，检测小分子
• Octet结果：KD = 4.74 uM
• 机理：WA结合PHGDH的295丝氨酸位点，封闭底物结合位点
• BLI原始数据：

陈老湿点评：
共价小分子解离比较慢，但是亲和力不一定很高，因为可能结合慢，知道kon/koff的重要性了吧。



辅酶和酶的结合测定[3]
单位：东北师范大学

• 小分子：丁酰辅酶 (BCoA）、丙二酰辅酶 (MCoA)
• 靶点：CPT1A
• 潜在适应症：非感染肠道炎症
• 实验方法：Octet RED96，NTA固化蛋白，检测辅酶
• Octet结果：定性检测，突变后的CPT1A与BCoA、MCoA结合（信号）能力降低
• 机理：膳食纤维可以在肠道中消化成丁酸，然后变成BCoA，BCoA与CPT1A底物MCoA结合位点相同（R243位点），但是BCoA不影响CPT1A活性，解除MCoA对CPT1A的抑制，增强脂肪酸氧化代谢，促进iTreg细胞分化维持肠道免疫稳态。
• BLI原始数据：

陈老湿点评：
多吃膳食纤维！



类固醇物质亲和力[4]
单位：中国药科大学

• 小分子：tubocapsenolide A
• 靶点：Src homology 2 phosphatase 2 (SHP-2)
• 潜在适应症：肿瘤
• 实验方法：Octet RED96e，NTA固化蛋白，检测小分子
• Octet：KD = 4.7 uM
• 机理：抑制Janus kinase信号通路，激活JAK/STAT3信号通路
• BLI原始数据：

陈老湿点评：
像这种每个浓度的结合曲线都可以快速达到饱和的小分子，可以用右边的静态拟合获得KD值哦。

Summary
     总结     

仪器用得好，主要取决于仪器性能、易用性、成本以及售后技术支持。

如此多的小分子文献已经说明仪器的优秀的灵敏度和检测性能。

Octet的技术支持人员从事该行业平均工作年限6年以上，保证了培训质量，并且客户培训的频率也比较高。

2021年4月21日，中国药科大学本部培训现场，每年至少一次对药大的培训，保证了仪器的使用率，仅在2021年上半年药大就有超过12篇文章引用了Octet数据。
再加上Octet的操作简便性和快速高通量的特点，所有这些促成了Octet的快速发展。

从国内文章的数量可以看到，Octet不仅买得起，而且用得起，支持得好！买Octet，加速您的科研进度！

-参考文献-
【1】Discovery and biological evaluation of a small‐molecule inhibitor of CRM1 that suppresses the growth of triple‐negative breast cancer cells. Traffic, 2021

【2】Identification of a novel PHGDH covalent inhibitor by chemical proteomics and phenotypic profiling. Acta Pharmaceutica Sinica B, 2021

【3】Butyrate enhances CPT1A activity to promote fatty acid oxidation and iTreg differentiation. Proceedings of National Acad Sciences, 2021

【4】Osteosarcoma cell proliferation suppression via SHP-2-mediated inactivation of the JAK/STAT3 pathway by tubocapsenolide A. Journal of Advanced Research,2021