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AB SCIEX 推出创新的蛋白质组学质谱应用新技术

SCIEX

2011/06/08 10:50

阅读:740

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  2011年6月8日,苏黎世联邦理工学院及 AB SCIEX(全球领先的生命科学分析技术公司)的科学家汇聚一堂,公布一项基于质谱应用的新技术,利用此项技术,科学家有史以来首次可以获得单独蛋白质组学样品分析中每个肽段的数据。SWATH 采集模式 是一项重大技术突破,使用质谱研究蛋白质组学的用户得以获知整个蛋白质组的完整数据。在与苏黎世联邦理工学院 Ruedi Aebersold 博士进行的 MRMAtlas 合作的过程中,AB SCIEX 将开发 MS/MSALL 增强功能,使 AB SCIEX TripleTOF™ 5600 系统可以运行 SWATH 采集模式供全球科学家使用。有关 SWATH 的详情将于本周在丹佛召开的美国质谱协会 (American Society of Mass Spectrometry, ASMS) 会议上公布。

  SWATH 采集模式是 Aebersold 博士及其在苏黎世联邦理工学院的团队共同开发,为未来的蛋白质组学研究提供的一种新的工作流程,该系统预计将产生令人震撼的蛋白质组学新发现,并克服目前的质谱平台中因数据重复而给科学家带来的困惑。本技术关键优势在于其能提供样品的完整定量与定性结果,该结果能按照提出的新假设经电脑模拟进行回溯性的挖掘。

  这一新技术是对 MRMAtlas 的完美补充,MRMAtlas 以质谱技术为基础,向大多数人类蛋白质组提供研究平台。全球科学家利用这一图谱极大推进了生物标志物研究、蛋白药物开发、基础生物及生物医学研究。MRMAtlas 提供简单及有效分析能力,探索蛋白质组中前所未见的新领域。利用 TripleTOF 5600 系统的 SWATH 采集模式,将有更多科学家能使用 MRMAtlas。

  现有高分辨率及轨道阱质谱系统仅能定性检测出复杂样品中的蛋白质子集,因为它们 MS/MS 获取速度相对较慢,且为探知更准确的定量结果,常常会采用其他仪器再次进样分析样品。面对这些挑战,AB SCIEX 开发出 SWATH 采集模式可以在单一进样分析中同时对所有蛋白质与肽进行定量与定性检测。

  与 Aebersold 博士及其团队共同展开的这一活动还将继续开发软件处理方法,更好解析 MRMAtlas 的数据。SWATH 采集模式 是 AB SCIEX 的 MS/MSALL 技术的延伸,只能在 TripleTOF™ 5600 上完成,这是因为需要将极高的采集速度与定量能力、精确质量及高分辨率整合在一起方可实现。MS/MSALL 以前已成功用于脂质组学及特种结构表达。现在进一步扩展此能力,MS/MSALL 采用 SWATH 采集模式,极大提高了工作效率,因此可以结合 LC/MS, 显著提高了质谱技术。

  瑞士联邦理工学院(苏黎世联邦理工学院)分子系统生物学学院Ruedi Aebersold 博士、教授

  “利用 SWATH 和 MRMAtlas,我们能够重新思考研究蛋白质组学的方法。我们能够利用前所未有的方法研究样品,我们预计这将产生令人震撼的新发现。与 AB SCIEX 合作使我们达到开发此项技术所必须的速度与定量层次,我们将向全球整个科学界提供这一技术。”

  AB SCIEX 制药与蛋白质组学业务部总经理兼副总裁 Dave Hicks

  “AB SCIEX 再一次与世界一流科学家紧密合作,推动质谱技术发展,达到其他任何厂家均难以想象的高度。TripleTOF 5600 系统提供的能力和速度使这一革命性的 SWATH 技术成为现实。我们预计这一发展将在接下来的几年中重振蛋白质组学研究。”

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