生物质谱
仪器信息网讯 2014年7月3日,由中国人类蛋白质组组织(CNHUPO)、中国物理学会质谱分会、中国化学会质谱分析专业委员会和复旦大学主办,AB SCIEX协办的“全国生物质谱学术报告会”在复旦大学隆重召开,约500名来自全国各地的相关研究人员参加了本次会议。
会议现场
会议邀请了苏黎世联邦理工学院Ruedi Aebersold教授、加拿大阿尔伯塔大学Liang Li教授、美国北卡罗来纳大学Xian Chen教授、约翰霍普金斯大学Hui Zhang教授、美国西奈山坎医学院Rong Wang教授、中科院大连化物所张玉奎院士、中科院上海生命科学研究院曾嵘研究员、中科院北京基因组研究所刘斯奇研究员和复旦大学杨芃原教授等国内外知名专家介绍了生物质谱的最新技术及应用研究进展。
TripleTOF 6600系统
会议期间,AB SCIEX隆重发布其在刚刚结束的ASMS 2014上推出的新一代蛋白质组学平台。该组学平台由TripleTOF 6600系统、SWATH 2.0采集技术、ProteinPilot 5.0软件及Eksigent nanoLC 400系统组成,从硬件到软件到工作流程都进行了改进和提升,使得研究人员每次实验都可以监测到所有的多肽和蛋白质,获得MRM级别的定量数据和高重现性的分析结果,让所有信息一览无余。
新品揭幕
(从左到右:AB SCIEX中国区总经理邵宏、复旦大学杨芃原教授、瑞士苏黎世联邦理工学院Ruedi Aebersold教授、中科院大连化物所张玉奎院士、AB SCIEX亚太区总裁Johnson Ho)
具体而言,TripleTOF 6600系统做了如下改进:(1)增强的检测器技术使得线性动态范围达到了5个数量级,更多低丰度蛋白质和肽段可以检测到;(2)Q1母离子选择的最大质荷比从1250提升至2250,可覆盖更多高质荷比的化合物;(3)图谱采集速度提高,每个SWATH循环可跨越200个可变窗口,使得更多肽段和蛋白质得以定量;(4)调整了TOF设计,更精确的温度控制,提高了质量准确度和稳定性;(5)采用动态累积时间功能提高二级谱图的质量。
而SWATH 2.0采集技术是此次推出新一代蛋白质组学平台中的一大亮点。2012年,AB SCIEX在当年的ASMS上首次推出采用SWATH采集技术TripleTOF 5600系统。SWATH采集技术是AB SCIEX与苏黎世联邦理工学院Ruedi Aebersold教授研究小组共同开发,并将其产业化,目前,该项采集技术只能在AB SCIEX TripleTOF 5600、6600系统上运行。据介绍,相比于目前流行的“鸟枪法”质谱数据依赖采集法(DDA)及靶向蛋白质组学策略(MRM),SWATH的数据非依赖采集法(DIA)可以定量分析数以千计的蛋白,从而完成对大样品量的数据分析,同时定量的数据具有非常高的完整性、精确度和重现性。这种高质量的定量数据过去只能利用被视为定量“黄金标准”的MRM方法获取,但其定量的蛋白数量非常有限,只能获得低水平蛋白的分析。
相比与上一代SWATH采集技术,SWATH 2.0提供了可变窗口,TripleTOF 6600系统每个SWATH采集循环最高可以实现200个采集窗口速度,在前体粒子密集时使用,增强选择性,最低可达2Da的质量数窗口;在前体粒子密度较低时使用,以确保覆盖更广泛的前体离子。
据悉,此次新品发布后,支持SWATH 2.0的TripleTOF 6600系统在中国正式上市销售。(撰稿:杨娟)
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