离子色谱的水一般建议使用高纯水，如果仅仅为一般性实验（如mg/L级别离子分析），则娃哈哈纯净水等也是可以使用的，但分析低含量（?g/L）级别的离子还是需要18.2MΩ/cm的高纯水，有时候不能相信国产的某些纯水机，其电导显示有一定的误差。如需要判断水是否可以使用，可以以纯净水为流动相，不经过色谱柱、抑制器直接进入电导检测器测定基线，优质的高纯水的电导率会在0.5?S/cm以下，一般认为1?S/cm以下的水可以用于分析低含量的离子。娃哈哈纯净水根据产品、批次的不同一般在3?S/cm左右，不可以使用更高电导率的水作为流动相的载体。实验室使用娃哈哈纯净水、蒸馏水或去离子水作为水源，配上进口的高纯水机是比较理想的选择。