这几种都是质量分析器的不同设计，最常见的的就是四极杆质量选择器，造价低廉，单位质量分辨率，能够满足一般定性和定量的要求，在实验室中普遍使用。QTOF是称作飞行时间质量选择器，可以做到较高的质量分辨率，但是造价比四极杆质量选择器高，使用成本也要高于常规的质谱，因为飞行时间质量选择器的稳定性受到环境温度的影响比较敏感；Triple Quad则是多级质量选择器，通过一定的反应模式得到子离子，可以很大程度去除干扰（同量异位素）。造价相对于单四极杆质量选择器贵许多，灵敏度也有一定提升，但是定性能力受到制约。因为不同的反应模式得到不同的子离子，不能形成统一的数据库进行计算机数据分析定性（谱库检索）。离子阱是比较特别的一种质量选择器，定性能力不错，但是定量方便性一般，实验室中使用不如四极杆质量选择器普及，如果结合起来就是另外一种Qtrap质量选择器，在液相色谱串联质谱仪器中有者不错的应用。