目前想用安捷伦的三重四级杆质谱做三磷酸脱氧核苷酸分析。因为化合物都是三磷酸形式，所以想用阴离子模式来做。但是经过色谱分离之后，两个核苷酸怎么都分不开 （母离子分别为467和482；但是子离子都选择检测那脱掉的三个磷酸（m/z = 159）以期待得到更好的灵敏度）。像这种情况相同迁移时间，相同子离子，不同母离子能做MRM定量不？？以前用质谱的时候只用了全离子扫描(TIC),然后用它的萃取离子图（Extracted ion chromatography）做的定量。现在的疑问是MRM图上的峰是由一组离子对（母/子离子对）构成的，还是只是由子离子构成的？如果是前者，那就算是相同迁移时间也应该没啥问题吧；但如果是后者是不是就必须先要用色谱分开两个化合物了？（这两个三膦核苷酸裂解后，只有一个可以得到很好的阳离子碎片。另一个只能检测三个磷酸）。先谢谢大家的热心帮助