水样的中和：如果水样的pH不在6-8之间，应使用盐酸溶液或氢氧化钠溶液的体积，再中和样品，不管有无沉淀的形成。稀溶液调节pH近于7，但用量不要超过水样体积的0.5%。
水样中含铜、铅、锌、镉、铬、砷、氰等有毒物质时，可使用经驯化的微生物接种液的稀释水进行稀释，或提高稀释倍数以减少毒物的浓度。
含有少量游离氯的水样，放置1-2小时；对于游离氯在短时间不能消散的水样，加入亚硫酸钠溶液，使样品中自由氯和结合氯失效，注意避免加过量。
将水样温度保持在20℃左右，在半充满的容器内摇动样品，以消除可能存在的过饱和氧。