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共有 3 人回复了该问答刚接触质谱的菜鸟想请教各位前辈一些问题!!!
 回复huanluoran发表于:2020/4/30 22:34:58悬赏金额:2积分 状态:未解决
      我本来是学测控的,可是最近老师让我学习一下质谱的数据处理方法,不巧实验室的硬盘坏了,所以老师让我先用matlab仿真数据再编程序处理。以前都没接触过质谱,查了一些资料也没什么头绪,这里我先说说自己的初步想法。

      因为以后有对比不同算法的处理效果的问题,主要的步骤定为(1)需要根据标准谱图把几种物质的峰值集合在一个数据集中;(2)加上噪声;(3)用算法去噪;(4)利用数据库对结果打分。

      想请教各位前辈的问题是:(1)我看到有些谱图是离散的峰值有些是连续的,这是为什么呢,我应该选择哪种形式仿真呢?(2)数据处理是建立在蛋白质大分子基础上的,我应该如何选择合适的标准谱图?我也看了很多数据库,可是因为没有明确的物质名称,完全不知道该怎么差·····(3)加上什么样的噪声才符合实际情况的呢?

      这个题目没有学长指导我一个人乱看资料速度实在太慢了,恳请前辈们给我一些建议!!!!
 回复  1# maldiguy  回复于:2020-05-02 12:17:58
现在常见质谱数据有两种格式,一种所谓的profile图(连续的),一种是棒状图(离散的)。但原始数据都是profile图,也就是针对每个质合比,都有一个响应的信号强度。将这些数据点连成曲线,就是一个profile图。所以profile图占用很多硬盘空间。现在高分辨质谱,一张质谱图就1M以上。如果走液质连用,每秒就算10张图,1小时的梯度下来,就有1*10*60*60=3600M,这个数据是很可怕的。所以需要将数据转存为棒状图。棒状图就是在profile图中,每检测到一个峰(取决于信噪比等),就保存该峰的分子量和信号强度。
对你的课题我不了解,但建议你在profile图上做文章
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