回复jinshuai发表于:2011/11/10 17:20:04悬赏金额:
30积分 状态:
已解决
大家好,
我是做代谢组的,用的安捷伦QTOF6520,分析软件用的MPP,想问一下,我想知道,相对定量即只是想知道处理组和对照组之间代谢物的差异,上下调关系,可不可以不用内标,这么做是否准确,谢谢
做代谢组学的相对定量完全没有必要用内标。
原本就是以各个通道的色谱面积总和为100%,计算各物质的相对面积比。不同物质在质谱中的响应原本就有较大差异,所以才叫相对定量。内标的加入完全没有意义,反而是添乱。
关键就是三点:1.基质相同。最好是来源于同一生物体的前后对照。
2.色谱分离度好。要把不同物质充分分离,不然代谢组学根本做不清。
3.各物质定性准确。尤其是在结构推测时,首先推测的化合物要全面,然后根据根据分离检测的结果慢慢挑,刚刚开始做这个方面时,这个过程比建立一个定量方法艰难痛苦多了。
楼上的大概全部是做定量的多吧,内标法是做定量的思路,相对定量更偏重定性方面呢。
不知楼主做的代谢组学是哪个方向的。如果以药物而言的话,要代谢物的总量超过药物总量的三分之一以上才考虑其意义,尤其还要验证其是否具有生理活性,没有生理活性的,只能算作其主要的代谢方式,具体的意义不大。当然,如果搞研究的话,可以和什么酶的活性啊,蛋白表达啊,基因多态性结合起来做。
总之,相对定量的那个所谓定量是很粗泛的,内标就不要加了。