最近需要用fourier mapping 来确定结构中缺失的原子。就是需要确定孔结构中，交换进去的离子的位置?

答：理解的没错的话，你想用差值Fourier法，来找到缺失的原子。也就是重原子法。

原理：F0-Fc, 也就是测得的结构因子减去现有计算的结构因子，最后得到残余电子密度。

软件实现：Shelxtl, GSAS, Fullprof，jana2006 均可以实现。

有没有什么教程介绍详细方法？

答：参见各软件的手册，都有说明，因为这个还是常规结构分析技术。很多软件都有这个功能。推荐：Shelxtl, jana2006

注意软件算法的局限性。