1．打开N2钢瓶的增压阀和使用阀，通N2；
2．开机过程：依次打开泵、柱温箱、自动进样器、系统控制器、PDA和PC各电源开关，双击LCMS Solution，进入在线分析界面；
3．更换流动相：将滤头放入已配制并抽滤后的流动相中，打开液相泵阀，以3ml/min的流速运行5min或在purge 状态运行3min，将管路中的超纯水或有机相替换成流动相；再将液相泵阀旋紧；
4．连接色谱柱，对自动进样器purge 15 min ;
5．参数设置：在“Setup Method”菜单中设置LC及MS各参数，如：在“LC acquisition parameters”中可调节流速、流动相组成、柱温、LC运行时间等，在“LC Program”中设置梯度洗脱程序及电磁切换阀的运行程序，在“MS acquisition parameters”中设置采集时间、离子模式（正\负）、采集方式（SIM\SCAN）、测定离子的m/z，在“MS quantitative parameters”中设置积分参数；
6．参数设置后，在“File”菜单中找出“save method file as” 将设定的方法保存，当再次做同类样品时可直接调用该方法。
7．序列的设置：序列文件中包括对瓶号、进样量、数据文件名、方法文件名、tuning 文件名的设定，当分析批量样品时，可使用“wizard” 程序设定schedule文件；设定过程按其程序指引步骤进行。
8．当色谱柱得以充分平衡后，拉开shutter, 打开雾化气和反吹气，将液相出口与质谱连接，按下“start”, 进行数据采集；
9．打印报告：在“Report" 中制作打印模板并在“Export Method" 中将其保存，然后在“Open Method" 中将该模板调出，即可打印各图谱；
10．进样结束后，同步骤3操作将流动相替换成超纯水及有机相（甲醇/乙腈），冲洗色谱柱及各管路（包括液相及质谱部分），时间在2小时左右；
11．停止运行液相泵，关闭雾化气和反吹气，依次关闭各控制单元开关，将机械泵排空10min；
12．用异丙醇对离子源部分进行清洗；
13．记录仪器使用情况，并记录签名。