楼主做三七的指纹图谱，看了一下你的色谱条件，除了梯度看不到，基本算是经典的方法。但是你的图谱实在是...
先看看别人的三七的指纹图谱



要指纹图谱走的好，色谱条件很关键，但是还有其他的细节。
三七的主要成分是皂苷，所以，指纹图谱主要是要测定皂苷，那么你的样品前处理就很重要，就是要把你要测定的成分从药材中提取出来。看了你的图谱，似乎很多标志性的皂苷不明显，所以，第一，你的样品提取方法是否有问题，这是你走好指纹图谱的前提。
再来看你的图谱，显然，梯度似乎不合适，导致有的地方没有峰，有的地方峰扎堆而没有分开，且峰形很难看。你应该先查好文献，大概知道三七里面的主要成分有哪些，用对照品大概摸一下你的梯度，峰少且间隔时间长的时间段，有机相比例和流速可以适当加大一些，遇到峰多的地方，有机相比例和流速可以适当的小一些，峰最好能基线分离，用梯度洗脱力求保证峰形好且分离的情况下，时间尽可能短。
还有基线下漂，看看平衡时间是否足够、检测池是否脏了等。

还有你的柱子是否干净？最好用空白溶剂先走一遍，以免出现鬼峰。

1.运行时间太长:应该是梯度不合适或流动相选择不合适.
2.色谱图谱中间无有峰出现,都在开始和结束出现,梯度不合适.
3.峰的分离情况不好.
4.检测的波长好象不太合适,在远紫外区时,溶剂的干扰大.
5.可以采用填料粒度更小,柱子短的色谱柱,来缩短分析时间.
6.是否有溶剂干扰,从图谱上看不出.

请问和为末端吸收？
请问末端吸收基线是上漂还是下漂？

不知道楼主想要哪些峰？
分离和峰形较差，柱子和流动相（梯度）是否适合？
分析时间太长，洗脱梯度可以增大一些。

一\运行时间太长,中间位置无峰;
二\峰形对灵敏度有影响.